Прочитать ввод hdf5 порциями в библиотеке rhdf5

Я хочу прочитать в матрице из hdf5 файл и напрямую преобразовать его в dgcMatrix так как он слишком велик для RAM, Есть ли способ сделать это в R? Вот что я хочу сделать:

dge <- as(h5read(path_to_file, 'rawcounts'), "dgCMatrix")

В настоящее время я получаю сообщение об ошибке из-за нехватки памяти.

0 ответов

Другие вопросы по тегам