glmmADMB - Ошибка максимизатора функции (не удалось найти файл параметров)
Моя модель имеет вид:
m1 <- glmmadmb(count_data ~ fixed1*fixed2 + (1|random/nested_random)
+ offset(log_total_counts), data = long_data_frame,
verbose=FALSE,family="nbinom2")
Это выполняется до конца на моем ноутбуке Mac (OS 10.13.4). Мне нужно перенести этот анализ на локальный кластер, поскольку мне нужно несколько 300000 запусков этих тестов glmmADMB. Поэтому я установил glmmADMB в кластере, следуя инструкциям на этом сайте: http://glmmadmb.r-forge.r-project.org/ который предлагает:
install.packages("R2admb")
install.packages("glmmADMB",
repos=c("http://glmmadmb.r-forge.r-project.org/repos",
getOption("repos")),
type="source")
Когда я бегаю, нареканий нет:
library(R2admb)
library(glmmADMB)
Но когда я запускаю один отдельный пример модели, я получаю следующую ошибку:
./glmmadmb: /lib64/libc.so.6: version `GLIBC_2.14' not found (required by ./glmmadmb)
Error in glmmadmb(copy ~ week * conc + (1 | pool/cell) + offset(log_tot_reads_orig), :
The function maximizer failed (couldn't find parameter file) Troubleshooting steps include
(1) run with 'save.dir' set and inspect output files;
(2) change run parameters: see '?admbControl';
(3) re-run with debug=TRUE for more information on failure mode
In addition: Warning message:
In system(cmd, intern = !verbose) :
running command './glmmadmb -maxfn 500 -maxph 5 -noinit -shess' had status 1
Я получил следующую информацию о моей среде в кластере:
glmmADMB:::get_bin_loc()
$bin_loc
[1] "local_path/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5/glmmADMB/bin/linux64/glmmadmb"
$platform
[1] "linux"
Я попытался выполнить шаги по устранению неполадок, предложенные на вышеуказанном веб-сайте
"Go to the Buildbot page and retrieve a binary that is compatible with your OS"
Но, к сожалению, страница Buildbot была мертвой гиперссылкой.
Почти наверняка это проблема со средой в моем кластере. Я был бы очень благодарен за предложения о том, как решить эту проблему, или за указатели на то, что можно изменить или обновить в кластере, которые я мог бы предложить своим местным администраторам. Большое спасибо!