allen-sdk get_flourescence_timeStamps

Question

Я полагаю, что загружаю файлы NWB правильно, так как могу без проблем получать информацию о следах и стимулах df/F. Тем не менее, я получаю сообщение об ошибке при попытке вызвать "get_running_speed":

AttributeError: у объекта 'BrainObservatoryNwbDataSet' нет атрибута 'get_flourescence_timeStamps'

Я получаю ту же ошибку, когда вызываю функцию get_fourescence_timeStamps. Я обновил пакеты allen sdk, поэтому я должен работать с самой последней версией программного обеспечения.

Это проблема, которую кто-то еще может повторить?

Answer 1

Правильно ли написано в вашем вопросе? get_flourescence_timeStamps с большой буквы "S" не является функцией. Ни то, ни другое get_fourescence_timeStamps с пропавшим без вести l,

Вот где эта функция вызывается внутри get_running_speed:

https://github.com/AllenInstitute/AllenSDK/blob/master/allensdk/core/brain_observatory_nwb_data_set.py

Похоже, оно написано правильно. Вот определение get_fluorescence_timestamps:

https://github.com/AllenInstitute/AllenSDK/blob/master/allensdk/core/brain_observatory_nwb_data_set.py

Не могли бы вы опубликовать небольшой фрагмент кода, который воспроизводит вашу ошибку?