Нарисуйте блокпост с использованием кадра в качестве источника данных

Я практикую свои навыки классификации ML в наборе данных Базы данных характеристик миллиардеров.

я использую sframe для загрузки и манипулирования данными и seaborn для визуализации.

В процессе анализа данных я хотел нарисовать рамку, сгруппированную по категориальной переменной, например, из seaborn руководство: блок-график, сгруппированный по категориям

В наборе данных есть networthusbillion числовая переменная и selfmade категориальная переменная, которая указывает, является ли миллиардер self-made или у него есть inherited баксы.

Когда я пытаюсь нарисовать похожий участок, используя sns.boxplot(x='selfmade', y='networthusbillion', data=data), он выдает следующую ошибку:

---------------------------------------------------------------------
AttributeError                            Traceback (most recent call last)
<ipython-input-17-f4bd651c2ae7> in <module>()
----> 1 sns.boxplot(x='selfmade', y='networthusbillion', data=billionaires)

/home/iulian/.virtualenvs/data-science-python2/lib/python2.7/site-packages/seaborn/categorical.pyc in boxplot(x, y, hue, data, order, hue_order, orient, color, palette, saturation, width, fliersize, linewidth, whis, notch, ax, **kwargs)
   2127     plotter = _BoxPlotter(x, y, hue, data, order, hue_order,
   2128                           orient, color, palette, saturation,
-> 2129                           width, fliersize, linewidth)
   2130 
   2131     if ax is None:

/home/iulian/.virtualenvs/data-science-python2/lib/python2.7/site-packages/seaborn/categorical.pyc in __init__(self, x, y, hue, data, order, hue_order, orient, color, palette, saturation, width, fliersize, linewidth)
    420                  width, fliersize, linewidth):
    421 
--> 422         self.establish_variables(x, y, hue, data, orient, order, hue_order)
    423         self.establish_colors(color, palette, saturation)
    424 

/home/iulian/.virtualenvs/data-science-python2/lib/python2.7/site-packages/seaborn/categorical.pyc in establish_variables(self, x, y, hue, data, orient, order, hue_order, units)
    136             # See if we need to get variables from `data`
    137             if data is not None:
--> 138                 x = data.get(x, x)
    139                 y = data.get(y, y)
    140                 hue = data.get(hue, hue)

AttributeError: 'SFrame' object has no attribute 'get'

Я попробовал следующие формы, чтобы нарисовать прямоугольник - ни один из них не достиг результата:

sns.boxplot(x=billionaires['selfmade'], y=billionaires['networthusbillion'])
sns.boxplot(x='selfmade', y='networthusbillion', data=billionaires['selfmade', 'networthusbillion'])

Тем не менее, я мог бы нарисовать прямоугольник, используя sframe, но без группировки по selfmade:

sns.boxplot(x=billionaires['networthusbillion'])

Итак, мой вопрос: есть ли способ нарисовать прямоугольник, сгруппированный по категориальной переменной, используя sframe? Может я что то не так делаю?

Кстати, мне удалось нарисовать его с помощью pandas.DataFrame используя тот же синтаксис (sns.boxplot(x='selfmade', y='networthusbillion', data=data)), так что, возможно, группировка с использованием sframe с seaborn просто еще не реализовано.

2 ответа

Решение

TL;DR

Группировка с использованием sframe с seaborn просто еще не реализовано.


Покопавшись в исходном коде seaborn, я обнаружил, что он разработан специально для работы с pandas.DataFrame, Приняв в ответ на это предложение абсолютно без гарантии, я получил следующую ошибку:

TypeError: __getitem__() takes exactly 2 arguments (3 given)

Взглянув на args в get функция по вызову, есть эти данные:

('gender', 'gender')

Это происходит из-за этого кода в исходном коде для BoxPlot:

# See if we need to get variables from `data`
if data is not None:
    x = data.get(x, x)
    y = data.get(y, y)
    hue = data.get(hue, hue)
    units = data.get(units, units)

Он пытается получить значение и использует то же значение, что и запасной вариант, если его не существует. Это вызывает ошибку в __getitem__()потому что он вызывается с (self, 'gender', 'gender') аргументы.

Я пытался переписать get() функционировать следующим образом:

def get(self, *args):
    return self.__getitem__(args[0]) if args[0] else None  # The `None` is here because the `units` in the source code is `None` for boxplots.

И вот я получил ошибку, которая закончила мои попытки:

TypeError: 'SArray' object is not callable

Взглянув на исходный код, он проверяет, y данные pd.Series а если нет, то конвертирует y значение в один:

if not isinstance(vals, pd.Series):
    vals = pd.Series(vals)

# Group the val data
grouped_vals = vals.groupby(grouper)

При выполнении vals.groupby(grouper) (окунь по-прежнему SArray экземпляр), это входит в основные работы панд, где SArray вызывается и выдается ошибка. Конец истории.

Проблема в том, что sns.boxplot ожидает, что данные имеют get метод, как Dataframe Панд. В Пандах get Метод возвращает один столбец, так что он такой же, как индексирование скобок, т.е. your_df['your_column_name'],

Самый простой способ обойти это - позвонить to_dataframe метод на вашем sframe, чтобы преобразовать его в dataframe.

sns.boxplot(x='selfmade', y='networthusbillion', data=data.to_dataframe())

В качестве альтернативы, вы можете обойти проблему, написав обертки классов или используя monkey-patching get на класс SFrame.

import numpy as np
import sframe
import pandas as pd
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt

# For demostration purposes
def to_sframe(df):
    import sframe
    d = {}
    for key in df.keys():
        d[key] = list(df[key])
    return sframe.SFrame(d)
pd.DataFrame.to_sframe = to_sframe

tips = sns.load_dataset('tips')

# Monkey patch sframe's get and _CategoricalPlotter's _group_longform
def get(self, *args):
    key = args[0]
    return self.__getitem__(key) if key else None
sframe.SFrame.get = get


def _group_longform(self, vals, grouper, order):
    """Group a long-form variable by another with correct order."""
    #import pdb;pdb.set_trace()

    if type(vals) == sframe.SArray:
        _sf = sframe.SFrame({'vals':vals, 'grouper':grouper})
        grouped_vals = _sf.groupby('grouper', sframe.aggregate.CONCAT('vals'))
        out_data = []
        for g in order:
            try:
                g_vals = np.asarray(grouped_vals.filter_by(g, 'grouper')["List of vals"][0])
            except KeyError:
                g_vals = np.array([])
            out_data.append(g_vals)
        label = ""
        return out_data, label

    ## Code copied from original _group_longform
    # Ensure that the groupby will work
    if not isinstance(vals, pd.Series):
        vals = pd.Series(vals)

    # Group the val data
    grouped_vals = vals.groupby(grouper)
    out_data = []
    for g in order:
        try:
            g_vals = np.asarray(grouped_vals.get_group(g))
        except KeyError:
            g_vals = np.array([])
        out_data.append(g_vals)

    # Get the vals axis label
    label = vals.name

    return out_data, label

sns.categorical._CategoricalPlotter._group_longform = _group_longform


# Plots should be equivalent
#1.
plt.figure()
sns.boxplot(x="day", y="total_bill", data=tips)
#2.
plt.figure()
sns.boxplot(x="day", y="total_bill", data=tips.to_sframe(),
            order=["Thur", "Fri", "Sat", "Sun"])
plt.xlabel("day")
plt.ylabel("total_bill")

plt.show()
Другие вопросы по тегам