Описание тега pysb

PySB - это фреймворк для построения математических моделей биохимических систем в виде программ Python. PySB абстрагирует сложный процесс создания уравнений, описывающих взаимодействия между множеством белков или других биомолекул, в простой и интуитивно понятный язык программирования для конкретной предметной области (см. Пример ниже), который внутренне переводится в правила BioNetGen или Каппа, а оттуда в системы уравнений. PySB упрощает разделение моделей на модули и вызов библиотек многоразовых элементов (макросов), кодирующих стандартные биохимические действия. Эти функции способствуют прозрачности, повторному использованию и точности модели. PySB также взаимодействует со стандартными научными библиотеками Python, такими как NumPy, SciPy и SymPy, что позволяет моделировать и анализировать модели.

Веб-сайт PySB находится по адресу http://pysb.org/.