Описание тега nipype

Описание тега Вопросы с тегом

Nipype: нейровизуализация в конвейерах и интерфейсах Python. Он позволяет использовать различные инструменты обработки изображений, такие как fsl, spm, afni, freesurfer и другие.

Nipype, инициатива с открытым исходным кодом, разработанная сообществом под эгидой NiPy, представляет собой проект Python, который обеспечивает единый интерфейс для существующего программного обеспечения нейровизуализации и облегчает взаимодействие между этими пакетами в рамках единого рабочего процесса. Nipype предоставляет среду, которая поощряет интерактивное изучение алгоритмов из разных пакетов (например, SPM, FSL, FreeSurfer, Camino, MRtrix, AFNI, Slicer), упрощает разработку рабочих процессов внутри пакетов и между ними, а также сокращает время обучения, необходимое для использования различных пакетов. пакеты. Nipype создает платформу для совместной работы для разработки программного обеспечения нейровизуализации на языке высокого уровня и устраняет ограничения существующих систем конвейеров.

Nipype позволяет:

легко взаимодействовать с инструментами из разных программных пакетов
объединить этапы обработки из разных программных пакетов
быстрее разрабатывать новые рабочие процессы, повторно используя общие шаги из старых
обрабатывать данные быстрее, выполняя их параллельно на многих ядрах / машинах
сделайте ваше исследование легко воспроизводимым
поделитесь своими рабочими процессами с сообществом