Описание тега r-qgraph

NoneA `R` language package that useing to visualize psychometric data.
1 ответ

Как включить p-значения <0,05 в q-графиках?

Я отвечаю на старый вопрос без ответа ( https://stackru.com/questions/31653029/r-thresholding-networks-with-inputted-p-values-in-q-graph). Я пытаюсь оценить отношения между моими переменными. Для этого я использовал карту корреляционной сети. После …
03 фев '16 в 13:10
0 ответов

Улучшить визуализацию большого сетевого графика в пакете qgraph

Я столкнулся с пакетом qgraph, и я так благодарен, что сделал, потому что у меня есть много красивых и информативных сюжетов. В настоящее время я работаю с более широкой базой данных из 755 метаболитов, измеренных у 15 видов бактерий в 2 временных т…
07 окт '14 в 09:07
0 ответов

R: группировать строки в матрице без использования значения в матрице

У меня есть пример матрицы, которая выглядит следующим образом: Unstim Unstim.1 Unstim.2 Unstim.3 Unstim.4 BB100 330 175 576 290 203 BB104 320 194 803 325 211 BB110 274 141 379 351 419 BB112 295 187 512 363 210` Я надеюсь сгруппировать имена строк в…
27 авг '15 в 21:03
1 ответ

Может ли qgraph визуализировать метки ребер вне фактического ребра?

Я пытаюсь вставить метки ребер вне фактического ребра в моем qgraph для удобства чтения. Мне особенно не нравится опция добавления белого надписи под надписью, это завинчивает край. В соответствии с инструкцией можно регулировать положение метки кро…
23 фев '16 в 11:27
1 ответ

R qgraph сетевой граф с переменным размером узлов?

В настоящее время я рисую qgraph (пружину) в R, но мне интересно, возможно ли изменить размер узлов в графе?
03 фев '17 в 10:08
1 ответ

Подавление ребер в qgraph на основе теста значимости

Я работаю над визуализацией сети, используя qgraph (который мне нравится больше, чем igraph). При попытке построить только значимые ребра я нахожу две проблемы: использование рекомендуемого способа выбора аргумента graph="sig" Я получаю следующее со…
11 фев '18 в 14:32
0 ответов

В qgraph возможно ли указать размер узла из списка ребер

Я использую край данных data.table с форматом col1, col2, weight и мой график должен быть направленным (col1 -> col2). Вызов qgraph() работает нормально, а края взвешены / окрашены, как и ожидалось, но я хочу, чтобы мои узлы были пропорциональны по …
19 дек '17 в 01:44
1 ответ

Как получить доступ к скрытым функциям, которые очень хорошо скрыты

Я пытаюсь изменить qgraph() Функция в пакете rgraph для внесения некоторых радикальных изменений в графические параметры. Но прежде чем пытаться внести эти изменения, я получил доступ к исходному коду для функции и перезагрузил его как новую функцию…
26 июл '17 в 11:39
0 ответов

Как изменить положение текстов узлов в R пакете "qgraph"?

В qgraph ( http://sachaepskamp.com/qgraph) есть ли способ изменить положение текста узла, чтобы не было совпадений текста (и не перекрытия узлов и текста)? В основном я хочу использовать те же функции, что и в пакете R ggrepel, см. Пример: https://c…
19 сен '17 в 09:33
2 ответа

igraph разрешить перекрывающиеся узлы с переменным размером узла r

Я создаю сетевую визуализацию одного "центрального" узла, окруженного примерно 600 узлами, используя igraph в R. Узлы перекрываются, и я могу решить, используя ответ на этот вопрос (используя qgraph). Однако, похоже, что это решение работает только …
20 дек '18 в 14:01
1 ответ

Сохранение qgraph не работает в цикле for, но снаружи

Я пытаюсь создать и сохранить несколько участков с qgraph(), Пока что попробовал: for (i in 1:100){ png(paste(i,".png",sep="_")) qgraph(l[[i]]) dev.off() } l список из 100 весовых матриц Создание сюжета вне цикла for работает без проблем. Цикл for т…
20 дек '18 в 15:27
0 ответов

Определенный цвет в сетевом сюжете

Я использую R для построения графика сети. Матрица взаимодействий выглядит &gt;mat 9 401 562 68 71 569 700 9 0 1 0 0 0 0 1 401 0 0 1 0 0 na 1 562 0 1 0 1 1 0 1 68 1 1 0 0 0 0 1 71 1 na 0 0 na 0 1 569 1 1 0 1 0 0 0 700 0 0 0 0 0 0 0 &gt;DT_mat&lt;-ma…
21 май '15 в 08:30
1 ответ

Как я могу сделать следующую картинку как сеть в R (qgraph или igraph)?

Я хотел бы сделать следующую картинку в R. Я рисую ее, но я бы хотел взвесить размер ребра в соответствии с его значением, использовать два разных цвета (красный и синий) и два разных типа ребра (пунктирный и не штриховой), Как мне это сделать? сете…
18 ноя '17 в 11:22
1 ответ

qgraph в R сокращает метки узлов

Я использую qgraph в R. Он автоматически сокращает метки узлов, что может быть очень полезно. Но как мне попросить использовать полные ярлыки? Вот пример. require(qgraph) m &lt;- matrix(1,3,3) colnames(m) &lt;- c("AAAAAAAA", "BBBBBBBB", "CCCCCCCC") …
21 июл '16 в 20:58
0 ответов

Как нарисовать узлы на концентрических окружностях в R?

Я использую пакет qgraph в R для создания сети из матрицы смежности. Я хочу, чтобы узлы отображались концентрическими кругами, один узел начинался посередине, а затем строил узлы на разных кругах. Я получил этот код для создания этих кругов и вычисл…
15 ноя '16 в 11:46
1 ответ

Как построить около нуля значения с qgraph?

Как я могу построить очень маленькие / близкие к нулю значения с qgraph-пакет в R? m &lt;- matrix( data = c( 1, 0.5, 0.1, 0.01 ), ncol = 2 ) library( qgraph ) qgraph( input = m )
11 дек '15 в 13:47
1 ответ

Использование разных типов линий ребер в qgraph

Я использую qgraph пакет для построения сети корреляций, которые показывают как положительные, так и отрицательные значения. Мне нужен график серой шкалы из-за ограничений журнала, поэтому цвет узлов можно легко установить, но у меня возникают трудн…
22 апр '16 в 08:45
1 ответ

Ошибка построения результатов алгоритма восхождения на холм из пакета bnlearn в R в виде графа дерева Рейнгольда-Тилфорда

Я новичок, но давно учусь на этом сайте. Это первый раз, когда ответ на мой вопрос не был реверс-инжиниринг с предыдущих постов, поэтому я надеюсь, что кто-то может помочь мне решить его. Я пытаюсь построить результаты алгоритма поиска восхождения н…
06 июл '16 в 00:39
1 ответ

qgraph: несколько изображений в узлах

Я недавно использовал Lavaan пакет в R для моделирования структурных уравнений и использовать semPlot пакет, который, кажется, совмещать с qgraph, в генерации путевых диаграмм. Я обнаружил, что qgraph имеет поддержку отображения изображений (таких к…
25 мар '13 в 18:59
1 ответ

Удаление узлов с неконечными весами ребер на графиках при использовании пакета qgraph в R

Я хочу видеть отношения в моих данных в сети и для этого использовал пакет qgraph , мои данные, комбинированные.данные, используются. Корреляция моих данных, которые я передал в качестве входных данных, имеет много значений NA. Команда, которую я ис…
16 янв '14 в 16:55