Описание тега adehabitathr
Пакет R для оценки домашнего расстояния
0
ответов
Язык R, проблемы с SpatialPixelsDataFrame
Следующие два сценария сгенерируют объект "SpatialPixelDataFrame": # FIRST library(rgdal) elev.grid <- readGDAL("whatever.asc") elev.grid <- as(elev.grid, "SpatialPixelsDataFrame") # SECOND library(raster) library(SDMTools) library(adehabitat)…
19 ноя '16 в 21:59
1
ответ
Ошибка в KernelUD "для соответствия домашнему диапазону требуется как минимум 5 перемещений"
У меня есть набор данных о движении летучей мыши в виде полигонов. Я создал одну случайную точку для каждого многоугольника и зациклил ее на 100 раз. Это создало фрейм данных, где каждая отдельная летучая мышь имеет 100 петли. Я пытаюсь создать kern…
21 сен '15 в 16:45
0
ответов
adehabitatHS; Предупреждение в presel() fxn
Я использую adehabitatHS, чтобы сделать анализ среды обитания третьего порядка на данных ошейника GPS. Все мои данные прочитаны нормально и, похоже, правильно отформатированы. Однако когда я бегу pks<-prepksel(slope, hr, cp) Warning message: In r…
08 сен '17 в 22:00
0
ответов
Как объединить несколько объектов estUD в объект estUDm для функции kerneloverlaphr.
Я создал несколько объектов estUD (предполагаемое распределение использования пространства одним животным) вне пакета adehabitatHR, используя второй метод на этой странице https://ecosystems.psu.edu/research/labs/walter-lab/manual/home-range-estimat…
28 июн '18 в 11:51
0
ответов
Как заставить rgdal/proj 4 работать на Mac
У меня возникают проблемы при попытке использовать пакет adehabitatHR в R. Когда я загружаю пакет rgdal, я получаю следующее сообщение об ошибке. > library(rgdal) Loading required package: sp rgdal: version: 1.0-7, (SVN revision 559) Geospatial D…
16 янв '17 в 17:46
0
ответов
Как конвертировать мои лат и лонги в UTM в моем фрейме данных
Я немного застрял на данный момент, я смог создать фрейм данных пространственных точек, и из этого я создал объект класса Ltraj. Это мне нужно будет сделать дальнейший анализ. Но мои координаты X и Y не в UTM, что может создать проблемы, если я сдел…
05 дек '16 в 04:14
1
ответ
Подмножество для минимального количества мест для MCP в R, отбрасывая отдельные имена
У меня есть очень похожий вопрос, который был опубликован здесь: Подмножество для минимального количества мест для MCP в R И здесь Подмножество данных кадра на основе количества строк на группу Где я пытаюсь установить набор данных, отбрасывая всех …
14 янв '18 в 16:40
1
ответ
Как создать один набор данных, который содержит два фрейма данных, используя файл Excel
Мне нужно создать один набор данных из файла Excel, который выглядит следующим образом 1. Когда я экспортирую файл, чтобы имитировать его в Excel, формат не работает правильно. Вот как выглядит файл, когда он экспортируется как Excel 2. Однако, когд…
12 дек '17 в 16:44
2
ответа
Ошибка: .onLoad не удалось выполнить в loadNamespace() для tcltk, подробности:call: fun(libname, pkgname)
В последнее время у меня возникли проблемы с библиотекой пакета "adehabitat". Я не знаю, что мне делать, чтобы справиться с проблемой. Может кто-нибудь знает и предложит мне помощь? Большое спасибо. > sessionInfo() R version 3.2.2 (2015-08-14) Pl…
08 сен '15 в 00:55
1
ответ
Создать границу для оценки дальности до дома (KUD)
Я использую adehabitatHR, чтобы оценить домашний диапазон для пингвинов. Естественно, они не могут плавать на суше, и я пытался добавить границу вокруг береговой линии, чтобы KUD не мог добавить больше территории, чем это возможно. Область, для кото…
08 мар '17 в 11:12
1
ответ
Почему разные домашние зоны с kernel.area и getverticeshr?
Я использовал kernelUD от adehabitatHR, чтобы оценить kuds для нескольких животных. Я тогда использовал kernel.area(x,percent=c(50,95),unout="m2",standardize=F) получить области kud50 и kud95 для каждого животного. Однако, когда я сравниваю данные з…
13 июл '15 в 12:02
0
ответов
Домашние ограждения диапазона в AdehabitatHR не работают
Я пытаюсь оценить домашний диапазон для набора точек, используя распределения ядра. Идея состоит в том, чтобы включить границу, которая охватывает все точки, имитирующие закрытый забор. Я смог сделать это, используя пакет adehabitatHR, который работ…
15 апр '18 в 18:10
0
ответов
adehabitatHR, LoCoH Проблема с бесхозными дырами
Я использую adehabitatHR для расчета HR с использованием LoCoH метод. Я пытаюсь найти оптимальные настройки, но у меня возникают проблемы, потому что при ряде настроек я получаю следующее: y<-LoCoH.k(mastermatrix, k=6, unin="m", unout="m", duplic…
24 авг '17 в 21:54
1
ответ
Удаление вектора ветра из вектора движения животных относительно земли для создания вектора движения животных в воздухе
У меня есть фрейм данных, который включает траекторию движения животного в широтных координатах. Из этого я получил скорость и опору на землю. Фрейм данных также содержит вектор ветра относительно положения животного, т.е. скорость и направление вет…
23 авг '18 в 13:27
0
ответов
Проблемы расчета Home Range с использованием AdehabitatHR
Я пытаюсь запустить модель LoCoH в R, используя AdehabitatHR. Если я запускаю функцию LoCoH.r, все идет хорошо, но если я пытаюсь запустить либо LoCoH.a, либо LoCoH.k, либо CharHull, я получаю следующее сообщение: Ошибка в TopologyFunc(groupID(spgeo…
15 окт '18 в 07:14
0
ответов
Паттерны, возникающие из случайной выборки
Я пытаюсь загрузить некоторые данные о радио-ошейнике, чтобы выявить внезапное, значительное увеличение в домашних диапазонах. Я взял данные ошейника и рандомизировал порядок точек, используя sample(), а затем создал 95% MCP на каждые 15 совокупных …
02 янв '18 в 21:55
2
ответа
Преобразование моих дат в класс POSIXct
В настоящее время я работаю над пакетом adehabitatLT. Я поместил свой столбец date_time в символы и назвал его da: да<-as.character (Даты $ date_time) голова (да) [1] "08.07.2015 0:22" "08.07.2015 0:52" "08.07.2015 1:22" "08.07.2015 1:52" "08.07.201…
01 дек '16 в 04:53
1
ответ
Возникли проблемы при расчете области Home Range
У меня много проблем с расчетом площади домашнего ареала животного. Я подумал, что однажды я произвел домашний диапазон (если я сделал это правильно), вычислить площадь будет легко, но нет Я вставил часть кода, который я пробовал. Интересно, у кого-…
29 авг '13 в 14:25
0
ответов
R Code adehabitatHR - Сетка слишком мала для оценки внутреннего диапазона ядра UD /getverticeshr/adehabitatHR
Извините за мой новый вопрос. Я все еще учусь, как проводить пространственный анализ в R. Я понимаю, что этот вопрос уже задавался ( здесь ). Цель: я не могу запустить этот код с смоделированными данными в параметрах специально для моих значений дол…
16 сен '18 в 17:48
0
ответов
Данные R-подмножества из пространственных данных
Я пытаюсь проанализировать пространственные данные в R. Я столкнулся с проблемами, пытаясь установить свои данные для анализа. Прежде всего мои исходные данные имели этот формат. Dataframe называется "locs": AnID X Y 1 Ind7 408046.3 5508986 2 Ind7 4…
15 авг '16 в 14:01