Невозможно построить график: для построения необходим matplotlib
Я могу создать файл *.dat:
vikas@server:~/memory_profiler-0.36$ ./mprof run --python test_sl.py
vikas@server:~/memory_profiler-0.36$ ls *.dat
mprofile_20151001035123.dat
Но когда я пытаюсь построить график, он говорит: "Для построения необходим matplotlib"
vikas@server:~/memory_profiler-0.36$ ./mprof plot --output=plot.png
matplotlib is needed for plotting.
Я что-то пропустил?
Функция, которую я профилирую, - это run(), которая находится внутри: file_to_be_profiled.py
#!/usr/bin/python
import time
import os, sys, commands
from memory_profiler import profile
from guppy import hpy
@profile
def run():
d = {}
l = []
hp = hpy()
before = hp.heap()
d["k1"] = 'val1'
d["k2"] = 10
count = 0
while (count < 9):
l.append(count)
print 'The count is:', count
count = count + 1
print "Good bye!"
after = hp.heap()
leftover = after - before
print leftover
if __name__ == '__main__':
sys.exit(run())
И я вызываю run() из моего тестового скрипта: test_sl.py:
#!/usr/bin/python
import commands
# for the time being I am running my test to profile method: run() inside file_to_be_profiled.py
run_cmd = './file_to_be_profiled.py
commands.getstatusoutput(run_cmd)
Я работаю на машине с Ubuntu. Но установка apt-get у меня не сработала. Затем я сделал установку из источника. Но тогда я тоже получаю ту же ошибку.
apt-get не удалось:
vikas@server:~/memory_profiler-0.36$ sudo apt-get install -y python-matplotlib
[sudo] password for vikaskuk:
Reading package lists... Done
Building dependency tree
Reading state information... Done
Package python-matplotlib is not available, but is referred to by another package.
This may mean that the package is missing, has been obsoleted, or
is only available from another source
E: Package 'python-matplotlib' has no installation candidate
vikask@server:~/memory_profiler-0.36$ ./mprof plot --output=plot.png
matplotlib is needed for plotting.
Затем я попытался установить pip... который также не прошел:
vikas@server:~/memory_profiler-0.36$ pip install matplotlib
Downloading/unpacking matplotlib
Cannot fetch index base URL https://pypi.python.org/simple/
Could not find any downloads that satisfy the requirement matplotlib
Cleaning up...
No distributions at all found for matplotlib
Storing debug log for failure in /home/vikaskuk/.pip/pip.log
Наконец я попытался установить из источника, который, кажется, успешно:
vikas@server:~/memory_profiler-0.36$ cd ../matplotlib
vikas@server:~/matplotlib$ cd matplotlib-master/
(virtualenv)vikaskuk@beehive:~/matplotlib/matplotlib-master$ vi INSTALL
(virtualenv)vikaskuk@beehive:~/matplotlib/matplotlib-master$ python setup.py build
============================================================================
Edit setup.cfg to change the build options
BUILDING MATPLOTLIB
matplotlib: yes [1.5.dev1]
python: yes [2.6.6 (r266:84292, Sep 15 2010, 16:22:56) [GCC
4.4.5]]
platform: yes [linux2]
REQUIRED DEPENDENCIES AND EXTENSIONS
numpy: yes [not found. pip may install it below.]
six: yes [using six version 1.5.2]
dateutil: yes [using dateutil version 2.1]
pytz: yes [pytz was not found. pip will attempt to install
it after matplotlib.]
tornado: yes [tornado was not found. It is required for the
WebAgg backend. pip/easy_install may attempt to
install it after matplotlib.]
pyparsing: yes [pyparsing was not found. It is required for
mathtext support. pip/easy_install may attempt to
install it after matplotlib.]
libagg: yes [pkg-config information for 'libagg' could not
be found. Using local copy.]
freetype: no [The C/C++ header for freetype2 (ft2build.h)
could not be found. You may need to install the
development package.]
png: no [pkg-config information for 'libpng' could not
be found.]
qhull: yes [pkg-config information for 'qhull' could not be
found. Using local copy.]
OPTIONAL SUBPACKAGES
sample_data: yes [installing]
toolkits: yes [installing]
tests: yes [using nose version 1.3.0 / using mock 1.0.1]
toolkits_tests: yes [using nose version 1.3.0 / using mock 1.0.1]
OPTIONAL BACKEND EXTENSIONS
macosx: no [Mac OS-X only]
qt5agg: no [PyQt5 not found]
qt4agg: no [PySide not found; PyQt4 not found]
gtk3agg: no [Requires pygobject to be installed.]
gtk3cairo: no [Requires cairocffi or pycairo to be installed.]
gtkagg: no [Requires pygtk]
tkagg: no [The C/C++ header for Tk (tk.h) could not be
found. You may need to install the development
package.]
wxagg: no [requires wxPython]
gtk: no [Requires pygtk]
agg: yes [installing]
cairo: no [cairocffi or pycairo not found]
windowing: no [Microsoft Windows only]
OPTIONAL LATEX DEPENDENCIES
dvipng: no
ghostscript: yes [version 8.71]
latex: yes [version 3.1415926]
pdftops: no
============================================================================
* The following required packages can not be built:
* freetype, png
(virtualenv)vikaskuk@beehive:~/matplotlib/matplotlib-master$ python setup.py install
============================================================================
Edit setup.cfg to change the build options
BUILDING MATPLOTLIB
matplotlib: yes [1.5.dev1]
python: yes [2.6.6 (r266:84292, Sep 15 2010, 16:22:56) [GCC
4.4.5]]
platform: yes [linux2]
REQUIRED DEPENDENCIES AND EXTENSIONS
numpy: yes [not found. pip may install it below.]
six: yes [using six version 1.5.2]
dateutil: yes [using dateutil version 2.1]
pytz: yes [pytz was not found. pip will attempt to install
it after matplotlib.]
tornado: yes [tornado was not found. It is required for the
WebAgg backend. pip/easy_install may attempt to
install it after matplotlib.]
pyparsing: yes [pyparsing was not found. It is required for
mathtext support. pip/easy_install may attempt to
install it after matplotlib.]
libagg: yes [pkg-config information for 'libagg' could not
be found. Using local copy.]
freetype: no [The C/C++ header for freetype2 (ft2build.h)
could not be found. You may need to install the
development package.]
png: no [pkg-config information for 'libpng' could not
be found.]
qhull: yes [pkg-config information for 'qhull' could not be
found. Using local copy.]
OPTIONAL SUBPACKAGES
sample_data: yes [installing]
toolkits: yes [installing]
tests: yes [using nose version 1.3.0 / using mock 1.0.1]
toolkits_tests: yes [using nose version 1.3.0 / using mock 1.0.1]
OPTIONAL BACKEND EXTENSIONS
macosx: no [Mac OS-X only]
qt5agg: no [PyQt5 not found]
qt4agg: no [PySide not found; PyQt4 not found]
gtk3agg: no [Requires pygobject to be installed.]
gtk3cairo: no [Requires cairocffi or pycairo to be installed.]
gtkagg: no [Requires pygtk]
tkagg: no [The C/C++ header for Tk (tk.h) could not be
found. You may need to install the development
package.]
wxagg: no [requires wxPython]
gtk: no [Requires pygtk]
agg: yes [installing]
cairo: no [cairocffi or pycairo not found]
windowing: no [Microsoft Windows only]
OPTIONAL LATEX DEPENDENCIES
dvipng: no
ghostscript: yes [version 8.71]
latex: yes [version 3.1415926]
pdftops: no
============================================================================
* The following required packages can not be built:
* freetype, png
Но когда я пытаюсь построить график, я сталкиваюсь с оригинальной проблемой:
vikas@server:~/matplotlib/matplotlib-master$ cd ../../memory_profiler-0.36
vikas@server:~/memory_profiler-0.36$ ./mprof plot --output=plot.png
matplotlib is needed for plotting.
Мне удалось успешно выполнить обновление apt-get (возникла проблема с брандмауэром, а затем я успешно выполнил: sudo apt-get install -y python-matplotlib.
Но все же я получаю некоторые проблемы при запуске mprof:
vikas@server:~/memory_profiler-0.36$ ./mprof plot --output=plot.png
Using last profile data.
Traceback (most recent call last):
File "./mprof", line 494, in <module>
actions[get_action()]()
File "./mprof", line 454, in plot_action
pl.figure(figsize=(14, 6), dpi=90)
File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/pyplot.py", line 423, in figure
**kwargs)
File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 79, in new_figure_manager
return new_figure_manager_given_figure(num, figure)
File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 87, in new_figure_manager_given_figure
window = Tk.Tk()
File "/usr/lib/python2.7/lib-tk/Tkinter.py", line 1767, in __init__
self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable
Почему мне нужно настроить дисплей? Я работаю на машине с Ubuntu.
4 ответа
Кажется, matplotlib: 3.0.1 не подходит для Python 3.7 в среде conda. Невозможно правильно выполнить команду df.plot(), показывая "ImportError: matplotlib требуется для построения графика", но на самом деле matplotlib установлен.
Я попытался понизить Matplotlib до 3.0.0, тогда все в порядке.
conda install -n [your_conda_envionment] matplotlib == 3.0.0
Вам необходимо установить matplotlib, как указано ( эта ошибка в mprof когда не может найти matplotlib).
Вы можете сделать это, используя пункт pip install matplotlib (вам может понадобиться префикс этого sudo) или ваш менеджер пакетов:
sudo apt-get install -y python-matplotlibна Debian, Ubuntu и производных.sudo yum install -y python-matplotlibна RHEL, CentOS и производных.
У меня была такая же проблема на свежеустановленной Ubuntu 16.04. Чтобы решить эту проблему, я установил SciPy так:
sudo pip install scipy
Также мне пришлось установить tkinter lib как это:
sudo apt-get install python-tk
Я думаю, где-то в прошлом, Matplotlib был scipy в качестве зависимости, но теперь он имеет только NumPy, в то время как mprof plot требует scipy,
У меня такая же проблема. Я использовал memory_profiler lib, набрав эти команды (mprof run runner.py а также mprof plot) и получил сообщение "необходим matplotlib для печати"
Я попытался избавиться от этой проблемы, следуя советам, которые я нашел здесь, но в результате я решил эту проблему, выполнив следующие простые шаги:
удалите файлы в /usr/lib64/python2.7/site-packages/, связанные с matplotlib (или вы можете удалить matplotlib обычным способом)
использование
sudo yum-builddep python-matplotlibдля установки подключенных пакетов (было установлено 222 пакета, если вам нужен apt-get, вам нужна эта команда:sudo apt-get build-dep python-matplotlib)установить matplotlib
sudo yum reinstall python-matplotlib(или используйте команду install с помощью apt-get:sudo apt-get install python-matplotlib)
Я верю, что это поможет.