R: Создать машиночитаемый вывод для сводки / описания
У меня есть фрейм данных с 10k строк и 500 столбцов. Для каждого столбца я хочу создать счетчик для каждого уникального значения в строке. Например
Fruit Vegetable Meat
1 Apple Carrot Steak
2 Apple Potato Chicken
3 Pear Peas Duck
Будет производить:
Fruit;Apple;2;Pear;1
Vegetable;Carrot;1;Potato;1;Peas;1
Meat;Steak;1;Chicken;1;Duck;1
Функция описания Hmisc производит такой анализ, но выходные данные настолько плохо отформатированы, что бесполезны.
Благодарю.
2 ответа
lapply(names(df),function(x){ tb <- table(df[[x]]);
write.table(file="test.csv", append=TRUE, quote=FALSE,
row.names=FALSE, col.names=FALSE, sep=";",
x= paste(x, paste( names(tb), tb, collapse=";", sep=";") ,
sep=";")
)})
#--------
fruit;Apple;2;Pear;1
veg;Carrot;1;Peas;1;Potato;1
meat;Chicken;1;Duck;1;Steak;1
Вы также увидите список из трех пустых значений, которые не будут отправлены в текстовый файл. Запись таблиц и матриц в файлы не является сильной стороной R. Существует write.matrix
функция в пакете::MASS. Мои первые усилия с writeLines
не удалось, потому что у него нет опции "добавить", и я не смог соединить вызов соединения, который бы append
,
(Другая проблема в R заключается в том, что обработка списка (и наследование кадра данных) с помощью 'apply / lapply / sapply' не передает names
элемента списка (и colnames
для фреймов данных) в функцию, поэтому функции "записи" не будут иметь внутренних имен для записи в файл. Вот почему я работал с names(df)
а не просто df
,
В качестве дальнейшего примечания, вероятно, существуют функции написания JSON, и они могут быть более надежными. Я посмотрю и доложу.
Существует пакет RJSONIO:
> require(RJSONIO)
Loading required package: RJSONIO
> toJSON(df)
[1] "{\n \"fruit\": [ \"Apple\", \"Apple\", \"Pear\" ],\n\"veg\": [ \"Carrot\", \"Potato\", \"Peas\" ],\n\"meat\": [ \"Steak\", \"Chicken\", \"Duck\" ] \n}"
Вы могли бы запустить table
функционировать через apply
Например
fruit <- c("Apple", "Apple", "Pear")
veg <- c("Carrot", "Potato", "Peas")
meat <- c("Steak", "Chicken", "Duck")
df <- data.frame(fruit, veg, meat)
apply(df, 2, table)
$fruit
Apple Pear
2 1
$veg
Carrot Peas Potato
1 1 1
$meat
Chicken Duck Steak
1 1 1