Построение регрессионных оценок на основе оценки и ст. одна ошибка
Я работаю с sjplot https://strengejacke.github.io/sjPlot/ и наслаждаюсь возможностью визуализации и сравнения оценок, как показано ниже (рабочий пример см. Ниже). Я задавался вопросом, возможно ли, на r, возможно, n ggplot2, построить результаты, основанные только на оценках и стандартных ошибках? Скажем, я вижу модель в статье и оцениваю свою собственную модель, и теперь я хочу сравнить мою модель с моделью из статьи, в которой у меня есть только оценки и стандартные ошибки. Я видел это на SO, но вроде бы и на основе моделей.
Любые отзывы или предложения будут оценены.
# install.packages(c("sjmisc","sjPlot"), dependencies = TRUE)
# prepare data
library(sjmisc)
data(efc)
efc <- to_factor(efc, c161sex, e42dep, c172code)
m <- lm(neg_c_7 ~ pos_v_4 + c12hour + e42dep + c172code, data = efc)
# simple forest plot
library(sjPlot)
plot_model(m)
Я предполагаю, что предварительный желаемый результат будет выглядеть примерно так,
Я только что натолкнулся на coefplot https://cran.r-project.org/web/packages/coefplot/ но я на машине без R, я знаю, странно, но я загляну в coefplot КАК МОЖНО СКОРЕЕ. возможно это возможный маршрут.
1 ответ
Вы можете легко сделать это с dotwhisker
пакет. Пакет по умолчанию отображает 95% CI как усы, но вы можете изменить фрейм данных, который вы вводите в качестве входных данных, чтобы изменить это.
# Package preload
library(dotwhisker)
library(broom)
library(dplyr)
# run a regression compatible with tidy
m1 <- lm(mpg ~ wt + cyl + disp + gear, data = mtcars)
# regression compatible with tidy
m1_df <- broom::tidy(x = m1) # create data.frame of regression results
m1_df # a tidy data.frame available for dwplot
#> # A tibble: 5 x 5
#> term estimate std.error statistic p.value
#> <chr> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
#> 1 (Intercept) 43.5 4.86 8.96 0.00000000142
#> 2 wt -3.79 1.08 -3.51 0.00161
#> 3 cyl -1.78 0.614 -2.91 0.00722
#> 4 disp 0.00694 0.0120 0.578 0.568
#> 5 gear -0.490 0.790 -0.621 0.540
# create new columns for upper and lower bounds
m1_df <- m1_df %>%
dplyr::mutate(
.data = .,
conf.low = estimate - std.error,
conf.high = estimate + std.error
)
# creating the dot and whisker plot
# note that whiskers correspond to standard error and not 95% CI
dotwhisker::dw_plot(m1_df)
Вы также можете увидеть примеры из виньеток, которые показывают, как можно изменить этот базовый график, особенно если вы хотите сравнить результаты по различным моделям: https://cran.r-project.org/web/packages/dotwhisker/vignettes/kl2007_examples.html