JupyterLab в установленной Homebrew Anaconda не запускает ядро, ищет старую установку

Я надеялся, что кто-нибудь может помочь мне понять, почему JupyterLab не может раскрутить ядро ​​в моей системе.

Фон

Я работаю над macOS High Sierra. Я имел обыкновение устанавливать Anaconda через установщик Mac OS в папку по умолчанию в моей домашней папке ($HOME/anaconda). Исходя из этой темы я удалил Анаконду.

Я переустановил анаконду из доморощенной бочки export PATH=/usr/local/anaconda3/bin:"$PATH" в моем .bashrc).

Эта проблема

Теперь, когда я

  • бежать jupyter-lab,
  • создать новую записную книжку и
  • выберите ядро ​​Python 3,

процесс завершается с таким выводом:

Traceback (most recent call last): File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/tornado/web.py", line 1543, in _execute result = yield result File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/tornado/gen.py", line 1099, in run value = future.result() File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/tornado/gen.py", line 1107, in run yielded = self.gen.throw(*exc_info) File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/notebook/services/sessions/handlers.py", line 73, in post type=mtype)) File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/tornado/gen.py", line 1099, in run value = future.result() File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/tornado/gen.py", line 1107, in run yielded = self.gen.throw(*exc_info) File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/notebook/services/sessions/sessionmanager.py", line 79, in create_session kernel_id = yield self.start_kernel_for_session(session_id, path, name, type, kernel_name) File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/tornado/gen.py", line 1099, in run value = future.result() File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/tornado/gen.py", line 1107, in run yielded = self.gen.throw(*exc_info) File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/notebook/services/sessions/sessionmanager.py", line 92, in start_kernel_for_session self.kernel_manager.start_kernel(path=kernel_path, kernel_name=kernel_name) File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/tornado/gen.py", line 1099, in run value = future.result() File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/tornado/gen.py", line 315, in wrapper yielded = next(result) File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/notebook/services/kernels/kernelmanager.py", line 148, in start_kernel super(MappingKernelManager, self).start_kernel(**kwargs) File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/jupyter_client/multikernelmanager.py", line 110, in start_kernel km.start_kernel(**kwargs) File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/jupyter_client/manager.py", line 259, in start_kernel **kw) File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/jupyter_client/manager.py", line 204, in _launch_kernel return launch_kernel(kernel_cmd, **kw) File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/jupyter_client/launcher.py", line 128, in launch_kernel proc = Popen(cmd, **kwargs) File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/subprocess.py", line 709, in __init__ restore_signals, start_new_session) File "/usr/local/anaconda3/lib/python3.6/subprocess.py", line 1344, in _execute_child raise child_exception_type(errno_num, err_msg, err_filename) FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: '~/anaconda/bin/python': '~/anaconda/bin/python'

Я уже удалил все ссылки на $HOME/anaconda (мое старое место установки) из моей среды (.bashrc, .bash_profile), поэтому я не могу понять, где ссылка берется.

Любые предложения будут ценны.

1 ответ

Решение

На этот вопрос ответили в этой теме GitHub для проекта Jupyter. Основное решение:

  • бежать jupyter kernelspec list чтобы увидеть, если он указывает на правильную установку Python
    • если нет, удалите папку ~/Library/Jupyter
    • повторный запуск jupyter kernelspec list

Это должно перестроить каталог и дать вывод как

Available kernels: python3 /usr/local/anaconda3/share/jupyter/kernels/python3

Это правильное место для установки Anaconda для Homebrew.

Другие вопросы по тегам