Не могу вставить графики в закладку

Question

Я использую bookdown для создания заметок для R. Минимальный пример bookdown, который показывает ошибку:

https://github.com/DavisBrian/bookdown_error

Все работало отлично, пока я не попытался добавить сюжет (dataviz.Rmd). При сборке книги я получаю следующую ошибку:

! LaTeX Error: File `dataviz_files/figure-latex/plotxyx-1' not found.

Error: Failed to compile rclassnotes.tex. See rclassnotes.log for more info.
In addition: Warning message:
In parse_packages(logfile, quiet = c(TRUE, FALSE, FALSE)) :
  Failed to find a package that contains dataviz_files/figure-latex/plotxyx-1
Execution halted

Exited with status 1.

Я запустил это под:

> sessionInfo()
R version 3.4.4 (2018-03-15)
Platform: x86_64-apple-darwin15.6.0 (64-bit)
Running under: macOS High Sierra 10.13.4

Matrix products: default
BLAS: /System/Library/Frameworks/Accelerate.framework/Versions/A/Frameworks/vecLib.framework/Versions/A/libBLAS.dylib
LAPACK: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/lib/libRlapack.dylib

locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] compiler_3.4.4  backports_1.1.2 bookdown_0.7    magrittr_1.5    rprojroot_1.3-2 htmltools_0.3.6 tools_3.4.4    
 [8] yaml_2.1.18     Rcpp_0.12.16    stringi_1.1.7   rmarkdown_1.9   knitr_1.20      xfun_0.1        stringr_1.3.0  
[15] digest_0.6.15   evaluate_0.10.1

Любые идеи о том, куда идти отсюда?

Редактировать:

Это выглядит очень похоже на: https://github.com/rstudio/bookdown-demo/issues/3 и https://github.com/rstudio/bookdown/issues/342

Обратите внимание, у меня есть эта проблема с Windows и Mac OSX. Я не думаю, что это простая ошибка установки программного обеспечения одного из компонентов.

Файлы, похоже, созданы в _bookdown_files/dataviz_files/figure-latex/ и временно в _dataviz_files/figure-latex/

Answer 1

Проблема была связана с тем, что вы установили графическое устройство на svg в _common.R: https://github.com/DavisBrian/bookdown_error/blob/9f4078a/_common.R#L13

knitr::opts_chunk$set(
  comment = "#>",
  collapse = TRUE,
  cache = FALSE,
  out.width = "70%",
  fig.align = 'center',
  fig.width = 6,
  fig.asp = 0.618,  # 1 / phi
  fig.show = "hold",
  dev = "svg"
)

LaTeX изначально не поддерживает изображения SVG (по крайней мере, на данный момент). Вы должны либо использовать специальные пакеты LaTeX, либо использовать формат изображения, который может распознавать LaTeX, например: pdf или же png,