Как закодировать эти данные в структуру parent / children в JSON

Я работаю с d3.js, чтобы визуализировать семейства животных (организмов) (до 4000 одновременно) в виде древовидного графа, хотя источником данных также может быть список каталогов или список объектов пространства имен. мои данные выглядят так:

json = {
    organisms:[
        {name: 'Hemiptera.Miridae.Kanakamiris'},
        {name: 'Hemiptera.Miridae.Neophloeobia.incisa'},
        {name: 'Lepidoptera.Nymphalidae.Ephinephile.rawnsleyi'},
        ... etc ...
    ]
}

мой вопрос: я пытаюсь найти лучший способ преобразовать вышеуказанные данные в иерархическую структуру данных parent / children, как это используется рядом визуализаций d3, таких как treemap (пример данных см. в flare.json в d3 / примеры / данные / каталог). Вот пример желаемой структуры данных:

{"name": "ROOT",
 "children": [
        {"name": "Hemiptera",
         "children": [
             {"name": "Miridae",
              "children": [
                  {"name": "Kanakamiris", "children":[]},
                  {"name": "Neophloeobia",
                   "children": [
                       {"name": "incisa", "children":[] }
                   ]}
              ]}
         ]},
        {"name": "Lepidoptera",
         "children": [
             {"name": "Nymphalidae",
              "children": [
                  {"name": "Ephinephile",
                   "children": [
                       {"name": "rawnsleyi", "children":[] }
                   ]}
              ]}
         ]}
    ]}
}

РЕДАКТИРОВАТЬ: заключить всю оригинальную желаемую структуру данных в ROOT узел, чтобы соответствовать структуре примеров d3, которые имеют только один главный родительский узел.

Я стремлюсь понять общий шаблон дизайна, и в качестве бонуса я хотел бы видеть некоторые решения в javascript, php (или даже в python). Я предпочитаю JavaScript Что касается php: данные, которые я на самом деле использую, поступают из обращения к базе данных через php-скрипт, который кодирует результаты как json. Результаты базы данных в сценарии php представляют собой упорядоченный массив (см. ниже), если он используется для ответов на основе php.

Array
(
    [0] => Array
        (
            ['Rank_Order'] => 'Hemiptera'
            ['Rank_Family'] => 'Miridae'
            ['Rank_Genus'] => 'Kanakamiris'
            ['Rank_Species'] => ''
        ) ........

где: 'Rank_Order' isParentOf 'Rank_Family' isParentOf 'Rank_Genus' isParentOf 'Rank_Species'

Я задал похожий вопрос, сфокусированный на решении php, но единственный ответ не работает на моем сервере, и я не совсем понимаю, что происходит, поэтому я хочу задать этот вопрос с точки зрения шаблона проектирования и включить ссылку для моего фактического использования, которое находится в javascript и d3.js.

3 ответа

Решение

Нижеследующее относится к предоставленной вами структуре, ее можно довольно легко сделать более общей. Я уверен, что функция addChild может быть упрощена. Надеюсь, комментарии полезны.

function toHeirarchy(obj) {

  // Get the organisms array
  var orgName, orgNames = obj.organisms;

  // Make root object
  var root = {name:'ROOT', children:[]};

  // For each organism, get the name parts
  for (var i=0, iLen=orgNames.length; i<iLen; i++) {
    orgName = orgNames[i].name.split('.');

    // Start from root.children
    children = root.children;

    // For each part of name, get child if already have it
    // or add new object and child if not
    for (var j=0, jLen=orgName.length; j<jLen; j++) {
      children = addChild(children, orgName[j]);      
    }
  }
  return root;

  // Helper function, iterates over children looking for 
  // name. If found, returns its child array, otherwise adds a new
  // child object and child array and returns it.
  function addChild(children, name) {

    // Look for name in children
    for (var i=0, iLen=children.length; i<iLen; i++) {

      // If find name, return its child array
      if (children[i].name == name) {
        return children[i].children;        
      }
    }
    // If didn't find name, add a new object and 
    // return its child array
    children.push({'name': name, 'children':[]});
    return children[children.length - 1].children;
  }
}

Учитывая ваш начальный ввод, я верю, что что-то вроде следующего кода даст желаемый результат. Я не думаю, что это самый красивый способ сделать это, но это то, что пришло на ум в то время.

Казалось, проще всего предварительно обработать данные, чтобы сначала разбить исходный массив строк на массив массивов, например:

[
   ["Hemiptera","Miridae","Kanakamiris" ],
   ["Hemiptera","Miridae","Neophloeobia","incisa" ],
   //etc
]

... а затем обработать это, чтобы получить рабочий объект в форме, примерно такой:

  working = {
       Hemiptera : {
           Miridae : {
              Kanakamiris : {},
              Neophloeobia : {
                  incisa : {}
              }
           }
       },
       Lepidoptera : {
           Nymphalidae : {
              Ephinephile : {
                  rawnsleyi : {}
              }
           }
       }
    }

... потому что работа с объектами, а не с массивами, облегчает проверку того, что дочерние элементы уже существуют. Создав указанную выше структуру, я обрабатываю ее в последний раз, чтобы получить окончательный желаемый результат. Так:

// start by remapping the data to an array of arrays
var organisms = data.organisms.map(function(v) {
        return v.name.split(".");
    });

// this function recursively processes the above array of arrays
// to create an object whose properties are also objects
function addToHeirarchy(val, level, heirarchy) {
    if (val[level]) {
        if (!heirarchy.hasOwnProperty(val[level]))
            heirarchy[val[level]] = {};
        addToHeirarchy(val, level + 1, heirarchy[val[level]]);
    }
}
var working = {};    
for (var i = 0; i < organisms.length; i++)
    addToHeirarchy(organisms[i], 0, working);

// this function recursively processes the object created above
// to create the desired final structure
function remapHeirarchy(item) {
    var children = [];
    for (var k in item) {
        children.push({
            "name" : k,
            "children" : remapHeirarchy(item[k])
        });
    }
    return children;
}

var heirarchy = {
    "name" : "ROOT",
    "children" : remapHeirarchy(working)
};

Демо: http://jsfiddle.net/a669F/1/

Альтернативный ответ на мой собственный вопрос.... За прошедший день я узнал немного больше о d3.js, и в связи с этим вопросом d3.nest() с.key() и.entries() мой друг (все функции d3). Этот ответ включает в себя изменение исходных данных, поэтому он может не рассматриваться как хороший ответ на конкретный вопрос, который я задал. Однако, если у кого-то есть похожий вопрос и он может что-то изменить на сервере, то это довольно простое решение:

вернуть данные из базы данных в следующем формате:

json = {'Organisms': [
    { 'Rank_Order': 'Hemiptera',
      'Rank_Family': 'Miridae',
      'Rank_Genus': 'Kanakamiris',
      'Rank_Species': '' },
    {}, ...
]}

Затем с помощью d3.nest()

organismNest = d3.nest()
    .key(function(d){return d.Rank_Order;})
    .key(function(d){return d.Rank_Family;})
    .key(function(d){return d.Rank_Genus;})
    .key(function(d){return d.Rank_Species;})
    .entries(json.Organism);

это возвращает:

{
key: "Hemiptera"
  values: [
    {
      key: "Cicadidae"
      values: [
        {
          key: "Pauropsalta "
          values: [
            {
              key: "siccanus"
              values: [
                       Rank_Family: "Cicadidae"
                       Rank_Genus: "Pauropsalta "
                       Rank_Order: "Hemiptera"
                       Rank_Species: "siccanus"
                       AnotherOriginalDataKey: "original data value"

etc etc, nested and lovely

Это возвращает нечто очень похожее на массив, который я описал как желаемый формат выше в вопросе, с некоторыми отличиями. В частности, не все включающие элемент ROOT, а также в то время как ключи, которые я первоначально хотел, были "name" и "children" .nest() возвращает ключи как "key" и "values" соответственно. Эти альтернативные ключи достаточно просты в использовании в d3.js, просто определяя соответствующие функции доступа к данным (базовая концепция d3) ... но это выходит за рамки первоначального вопроса... надеюсь, что это кому-то тоже поможет

Другие вопросы по тегам