Как оси графика MDS связаны с отношением S:N?
Скажем, у меня есть график MDS, как показано ниже:
Теперь, скажем, все на графике MDS выглядит точно так же (положение цветных точек не меняется). Но меняется только одно: ось х ("первое измерение"):
1) Если пределы оси x составляют от -200 до 100, скажем (вместо -100 до 50, как в настоящее время), и все точки отображаются на одинаковом расстоянии друг от друга, можно ли сказать, что отношение S:N лучше (то есть группы лучше разделены), потому что предел оси X больше?
2) Если в одном случае ось X объясняет 25% отклонения, но в другом случае ось X объясняет 75% отклонения, если все точки появляются на одинаковом расстоянии друг от друга в обоих случаях, можно ли сказать отношение S:N лучше во втором случае, так как эти расстояния между точками (выборками) можно объяснить еще большим изменением?
Спасибо, что предложили свои идеи на эти вопросы!
1 ответ
Я не думаю, что вы можете интерпретировать оси так. MDS - это просто метод разделения точек, разделенных в трехмерном пространстве на 2 измерения. Вы не можете определить, какую пропорцию объясняет каждая из осей в MDS, в отличие от других ограниченных методов (PCA и т. Д.). Вместо этого вам предоставляется статистика R, а когда эта статистика R превышает 0,20, это означает, что ваша MDS плохо представляет различия между точки.
Извините, что я не могу дать более "математический" ответ.