Формат ввода метис-графика

Мне поручено использовать разделитель METIS, чтобы выполнить декомпозицию домена в качестве входной информации для MPI-версии нашего иерархического кода решетки Больцмана. Минимальный пример графа сетки выглядит следующим образом:

Из-за природы численного алгоритма "красные" вершины в 2 раза дороже в вычислительном отношении, чем "синие" вершины. За шаг по времени алгоритм выполняет два шага вычисления для "красного", затем один шаг вычисления для "синего". Пока все просто. Мой файл метис-графика будет выглядеть так:

12 17 010
2  2  5
2  1  3  5
2  2  4  6
2  3  6
1  1  2  6  7
1  3  4  5  8
1  5  8  9
1  6  7 10
1  7 10 11
1  8  9 12
1  9 12
1 10 11

Который производит разделение так:

Вычислительные веса сбалансированы, но количество "красных" и "синих" вершин в каждом разделе не равно. Вместо этого мне нужно разделение, которое выглядит примерно так:

Каждому разделу требуется одинаковое количество весов в сочетании с ограничением, что количество "красных" вершин составляет ок. то же самое в каждом разделе. То же самое для "синих" вершин. Я экспериментировал с более чем одним весом на вершину, но безрезультатно. Метис "мануал" не сильно помогает. Как должен выглядеть мой входной файл метисов, чтобы получить разделение на третьем изображении вместо второго?

Изменить: проблема решена... по крайней мере вопрос, как должен выглядеть входной файл метисов:

12 17 010 2
2 0  2  5
2 0  1  3  5
2 0  2  4  6
2 0  3  6
0 1  1  2  6  7
0 1  3  4  5  8
0 1  5  8  9
0 1  6  7 10
0 1  7 10 11
0 1  8  9 12
0 1  9 12
0 1 10 11

Добавление веса второй вершины к файлу кажется правильным способом сделать это. Проблемы, которые у меня были (и почему я изначально думал, что это неправильно) связаны с ошибкой в ​​более поздних выпусках paraview. Я использовал версию pv>=5, которая дает странные результаты при применении порогового фильтра для проверки отдельных разделов, созданных metis. С более старыми версиями результаты выглядят хорошо. Плюс мне пришлось разрешить "несмежные" разделы во входном файле метисов.

0 ответов

Другие вопросы по тегам