Проблема с установкой пакета R: sf; системная библиотека не найдена

Question

Я пытаюсь установить пакет R sf. Упоминаются системные зависимости GDAL, GEOS и PROJ.4. Я установил все это, используя
$sudo apt-get install libgdal-dev libgeos-dev libproj-dev proj-bin
Однако sf по-прежнему жалуется, что в нем отсутствуют (что-то из?) Библиотеки:

$sudo R CMD INSTALL sf_0.6-3.tar.gz
[...]
configure: pkg-config proj exists, will use it
checking proj_api.h usability... yes
checking proj_api.h presence... yes
checking for proj_api.h... yes
configure: PROJ: 4.9.2
checking for pj_init_plus in -lproj... no
configure: error: libproj not found in standard or given locations.
ERROR: configuration failed for package ‘sf’  

То же самое касается использования install.packages("sf") команда в R. Я использую R версии 3.5.0 в системе Ubuntu 16.04, мне удалось установить пакет на другой компьютер с R версией 3.4.3, но я не знаю, что я сделал по-другому, чтобы он работал тогда. Как уместно, так и pkg-config --modversion proj Скажите, что версия выше, чем нужно (4.9.2), и я попытался найти информацию, которая могла бы помочь мне решить проблему с помощью pkg-config или в Интернете, но не смог ничего найти. Я нашел следующую строку в /usr/include/proj_api.h (найден с помощью sudo apt-file search proj_api.h):
projPJ pj_init_plus(const char *);
который упоминает вещь в чеке не найдена, но я не понимаю, как это связано с этим.

Как примечание, у меня есть две версии R, у меня также есть версия 3.2.3 на компьютере. Может ли это быть источником проблемы? (Я уверен, что версия, в которую я устанавливаю пакет sf - 3.5)

РЕДАКТИРОВАТЬ

Я нашел другой пакет R (proj4) с зависимостью libproj и попытался установить его. В то время как это действительно останавливалось на той же самой ошибке, этот дал более длинное сообщение:

>install.packages("proj4")
[...]
checking proj_api.h usability... yes
checking proj_api.h presence... yes
checking for proj_api.h... yes
checking for pj_init_plus in -lproj... no
configure: error: libproj and/or proj_api.h not found in standard search locations.

*** Install PROJ.4 and if necessary set PKG_CPPFLAGS/PKG_LIBS accordingly.
ERROR: configuration failed for package ‘proj4’

Переменные PKG_CPPFLAGS/PKG_LIBS? не найдены в R, и echo $PKG_LIBS тоже ничего не показывал. Может ли быть способ, которым я мог бы установить их, чтобы пакеты могли быть установлены?

Я благодарен за любые подсказки или подсказки относительно того, что вызывает это.

Питер

Answer 1

Я думаю, что вы, возможно, используете старые версии libgdal-dev, и вы

следующий вопрос может быть проблемой, которую вы видите

Rgdal установка не удалась на Ubuntu 16.04

sudo add-apt-repository -y ppa:ubuntugis/ubuntugis-unstable
sudo apt update
sudo apt install gdal-bin python-gdal python3-gdal libgdal1-dev