R - рассчитать вероятность и перевернуть ось x/y кумулятивной кривой (ECDF)

В R I построите кумулятивную кривую, используя функцию ecdf для отображения площади и высоты. По умолчанию высота отображается на оси x, в области на оси y, где высота указывается в общих значениях (например, 1000–3000 м), и в области вероятности (0,0–1,0).

  • Я хотел бы показать повышение в процентах / значения вероятности тоже.

  • Я хотел бы перевернуть ось и визуализировать область на оси х и высоту на оси у.

Как я могу это сделать? Я не мог найти решение.

Это мой код:

library(rgdal)
setwd("G:/data")
raster <- readGDAL("elevation.tif")
plot(ecdf(raster$band1), main="Hypsometric curve")

1 ответ

Решение

Практически любое решение начнется с создания массива, представляющего все вершины в графике. Они получены путем извлечения координат из ecdf объект. Для иллюстрации давайте сгенерируем некоторые данные.

n <- 32
k <- floor(n/2)
x <- 1 - runif(n)^2
x <- c(x, sample(x, k, replace=TRUE))

Вот стандартный расчет ECDF и график, для справки:

f <- ecdf(x)
plot(f, main="Default Plot")

ECDF сюжет

R предпочитает помещать данные в data.frame объекты. Вот один из способов. Обратите внимание, как диапазон данных немного расширяется, чтобы показать естественные конечные точки кривой, которая начинается на уровне y=0 и заканчивается на уровне y=1:

expand <- function(x, f=1.05, ...) {# Expand a data range
  r <- range(x, ...)
  (r - mean(r)) * f + mean(r) 
}
X <- with(environment(f), {
  x.range <- expand(x)
  data.frame(x=c(x.range[1], x), 
             xend=c(x, x.range[2]),
             y=c(0, y),
             yend=c(0, y))
})

С этой удобной структурой данных X на месте, все что осталось, это описать сюжет. я использую ggplot2 за это:

library(ggplot2)
g.ECDF <- ggplot(X, aes(x=x, y=y, xend=xend, yend=yend)) + 
  geom_hline(yintercept=0:1, linetype=2, size=1.0, color="Gray") +
  geom_segment(color="#b0b0b0", size=0.8) +
  geom_point(data=X[-1,]) +
  xlab("Elevation") + ylab("Proportion of Total") + 
  ggtitle("Hypsometric Curve")

print(g.ECDF)

версия ECDF для ggplot2

Теперь для государственного переворота: просто скажи ggplot2 для переключения осей:

print(g.ECDF + coord_flip() + ggtitle("Axes Flipped"))

Перевернутый ECDF

Другие вопросы по тегам