Максимальная ситуация RJava 1001
Я боролся с преодолением серии ошибок за использование функции maxent
в dismo
пакет.
Loading required package: rJava
Unable to find any JVMs matching version "(null)".
No Java runtime present, try --request to install.
Error: package or namespace load failed for ‘rJava’:
.onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
error: unable to load shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so':
dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so, 6): Library not loaded: @rpath/libjvm.dylib
Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so
Reason: image not found
Error: package ‘rJava’ could not be loaded
In addition: Warning message:
running command '/usr/libexec/java_home' had status 1
Я пытался: 1- обновить мою версию R 2- удалить и переустановить последнюю версию Java 3- удалить и переустановить rJava 4- установить JGR
Никто не решил проблему. Любая помощь там?
2 ответа
На терминальной консоли выполните:
machine-name:~ username$ which java
/usr/bin/java
machine-:~ username$ java -version
java version "1.8.0_131"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.8.0_131-b11)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 25.131-b11, mixed mode)
Поскольку у меня установлена jre, я могу зайти в R и запустить:
> library(rJava)
> help(pac=rJava)
> res <- .jinit(classpath="myClasses.jar", parameters="-Xmx512m")
> res
[1] 0 # the sign of a successful initiation
Вы должны отображать похожую информацию, как показано ниже:
> sessionInfo()
R version 3.4.0 (2017-04-21)
Platform: x86_64-apple-darwin15.6.0 (64-bit)
Running under: OS X El Capitan 10.11.6
Matrix products: default
BLAS: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/lib/libRblas.0.dylib
LAPACK: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/lib/libRlapack.dylib
locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8
attached base packages:
[1] parallel stats4 grDevices utils datasets graphics stats
[8] methods base
other attached packages:
[1] rJava_0.9-8 MASS_7.3-47 copula_0.999-16
snipped the rest of my loaded package listing
У меня никогда не было успеха в работе с JGR, поэтому я не могу помочь в этом вопросе.
У меня была такая же проблема... для меня это сработало:
- Удалите Java и установите снова, но обязательно установите 64-битную версию.
Затем установите пакеты
install.packages("rJava"); install.packages("dismo")
здесь: http://biodiversityinformatics.amnh.org/open_source/maxent/ вы загружаете maxent... затем вставляете файл "maxent.jar" в папку "java" пакета "dismo". Вы должны сделать это перед загрузкой библиотек. Вы найдете каталог вашего пакета dismo со следующим:
system.file ("java", package = "dismo")
В вашей системе откройте regedit. Вам нужно будет создать ключ Prefs в папке JavaSoft. По моему, это здесь: Computador\HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\JavaSoft ... В зависимости от вашей системы, это может быть здесь: HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Wow6432Node\JavaSoft ... так, посмотрите, и убедитесь, что вы создаете Prefs в правильный каталог. Затем:
Щелкните правой кнопкой мыши в JavaSoft > New > Key > и назовите ключ как Prefs. это должно работать сейчас. Загрузите библиотеки и попробуйте.