Пропущенные имена фрагментов в коде R в Knitr

Question

Пропущенные имена фрагментов в коде R в Knitr

Когда используешь Stangle на Sweave документ, вывод включает в себя комментарий, который дает имя чанка. Это невероятно полезно в условиях обучения, чтобы ориентировать студентов в коде, когда они вырезали и вставляли. Тем не менее, когда я использую knitr генерировать .R код из .Rnw, имена чанков не включены (по крайней мере, что я вижу):

knit('example.Rnw',tangle=TRUE)

Я мог бежать Stangle на документе, написанном для knitr за исключением того, что в аргументах чанка есть несовместимости, которые препятствуют выполнению Stangle без ошибок.

Есть ли способ заставить knitr производить комментарии в запутанном R код, который включает в себя имена чанков (и / или номера), такие как native Stangle ?

4

r knitr sweave noweb

Источник

user459633 25 янв '14 в 16:22

1 ответ

Решение

Другие вопросы по тегам r knitr sweave noweb

user190277 25 янв '14 в 19:10 2014-01-25 19:10 · Accepted Answer · 2014-01-25 19:10

Благодаря @kohske (я только что понял это для себя...)

purl() имеет documentation аргумент, который по умолчанию равен 1 (1= добавить заголовки чанка в код; 0 ничего не делает, 2 добавляет заголовки чанка в качестве комментариев roxygen). Если вы хотите придерживаться knit(.,tangle=TRUE) вам просто нужно opts_knit$set(documentation=1) до запутывания.