Некоторые программы не допускают подстановку процессов для входных файлов?

Я пытаюсь использовать процесс подстановки для входного файла в программу, и это не работает. Это потому, что некоторые программы не допускают подстановку процессов для входных файлов?

Следующее не работает:

bash -c "cat meaningless_name"
    >sequence1
    gattacagattacagattacagattacagattacagattacagattacagattaca
    >sequence2
    gattacagattacagattacagattacagattacagattacagattacagattaca
bash -c "clustalw -align -infile=<(cat meaningless_name) -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Less verbose output, finishing with:
    No sequences in file. No alignment!

Но следующие элементы управления работают:

bash -c "clustalw -align -infile=meaningless_name -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Verbose output, finishing with:
    CLUSTAL-Alignment file created  [output_alignment.aln]
bash -c "cat <(cat meaningless_name) > meaningless_name2"
diff meaningless_name meaningless_name2
    (No output: the two files are the same)
bash -c "clustalw -align -infile=meaningless_name2 -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Verbose output, finishing with:
    CLUSTAL-Alignment file created  [output_alignment.aln]

Это говорит о том, что сама подстановка процессов работает, но что программе clustalw сама по себе не нравится подстановка процессов - возможно, потому, что она создает нестандартный файл или файлы с необычным именем файла.

Часто ли программы не принимают замещение процесса? Как я могу проверить, является ли это проблемой?

Я использую GNU bash версии 4.0.33(1)-релиз (x86_64-pc-linux-gnu) в Ubuntu 9.10. Clustalw - это версия 2.0.10.

Источник

2 ответа

Решение

Да. Я заметил то же самое в других программах. Например, в emacs это тоже не работает. Это дает "Файл существует, но не может быть прочитан". И это определенно специальный файл для меня /proc/self/fd/some_number, И это не работает надежно ни в less ни most, с настройками по умолчанию.

Для большинства:

most <(/bin/echo 'abcdef')

и короче ничего не показывает. Более длинные значения усекают начало. less видимо работает, но только если вы укажете -f,

Я нахожу Zsh's = гораздо полезнее на практике. Синтаксически то же самое, кроме = вместо <, Но он просто создает временный файл, поэтому поддержка не зависит от программы.

РЕДАКТИРОВАТЬ:

Я нашел Zsh использует TMPPREFIX выбрать временное имя файла. Так что даже если вы не хотите, чтобы ваш реальный /tmp быть tmpfs Вы можете смонтировать один для Zsh.

Источник

Подстановка процесса создает именованный канал. Вы не можете искать в именованной трубе.

Источник
Другие вопросы по тегам