Пакет GWmodel не загружается
Версия2.2-9из (установлено изCRAN) не загружается. Переустановка пакета также не решает проблему. я тоже пробовалdetachingвсе загруженные пакеты и попытался снова загрузить пакет, но это не удалось. Я предполагаю, что проблема связана с тем, как пакеты (STFDF-class function) иraster(RasterBrick function) загружаютсяGWmodel. Я попытался найти проблему наGithubи большинство вопросов связано сgstatpackage и, кажется, нет четкого решения этой проблемы.
detachAllPackages <- function() {
basic.packages <- c("package:stats","package:graphics","package:grDevices","package:utils","package:datasets","package:methods","package:base")
package.list <- search()[ifelse(unlist(gregexpr("package:",search()))==1,TRUE,FALSE)]
package.list <- setdiff(package.list,basic.packages)
if (length(package.list)>0) for (package in package.list) detach(package, character.only=TRUE)
}
detachAllPackages()
Как я могу это исправить?
Ошибка:
Error: package or namespace load failed for ‘GWmodel’:
package slot missing from signature for generic ‘coerce’
and classes STFDF, RasterBrick
cannot use with duplicate class names (the package may need to be re-installed)
Информация о сеансе:
─ Session info ─────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
setting value
version R version 4.2.1 (2022-06-23 ucrt)
os Windows 10 x64 (build 22000)
system x86_64, mingw32
ui RStudio
language (EN)
collate English_United States.utf8
ctype English_United States.utf8
tz America/New_York
date 2022-09-12
rstudio 2022.07.1+554 Spotted Wakerobin (desktop)
pandoc 2.18 @ C:/Program Files/RStudio/bin/quarto/bin/tools/ (via rmarkdown)
─ Packages ─────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
package * version date (UTC) lib source
abind * 1.4-5 2016-07-21 [1] CRAN (R 4.2.0)
assertthat 0.2.1 2019-03-21 [1] CRAN (R 4.2.1)
backports 1.4.1 2021-12-13 [1] CRAN (R 4.2.0)
bitops 1.0-7 2021-04-24 [1] CRAN (R 4.2.0)
boot 1.3-28 2021-05-03 [1] CRAN (R 4.2.1)
broom 1.0.0 2022-07-01 [1] CRAN (R 4.2.1)
cachem 1.0.6 2021-08-19 [1] CRAN (R 4.2.1)
callr 3.7.1 2022-07-13 [1] CRAN (R 4.2.1)
car 3.1-0 2022-06-15 [1] CRAN (R 4.2.1)
carData 3.0-5 2022-01-06 [1] CRAN (R 4.2.1)
cellranger 1.1.0 2016-07-27 [1] CRAN (R 4.2.1)
class 7.3-20 2022-01-16 [1] CRAN (R 4.2.1)
classInt 0.4-7 2022-06-10 [1] CRAN (R 4.2.1)
cli 3.3.0 2022-04-25 [1] CRAN (R 4.2.1)
cluster 2.1.3 2022-03-28 [1] CRAN (R 4.2.1)
coda 0.19-4 2020-09-30 [1] CRAN (R 4.2.1)
codetools 0.2-18 2020-11-04 [1] CRAN (R 4.2.1)
colorspace 2.0-3 2022-02-21 [1] CRAN (R 4.2.1)
cowplot * 1.1.1 2020-12-30 [1] CRAN (R 4.2.1)
crayon 1.5.1 2022-03-26 [1] CRAN (R 4.2.1)
crosstalk 1.2.0 2021-11-04 [1] CRAN (R 4.2.1)
curl 4.3.2 2021-06-23 [1] CRAN (R 4.2.1)
data.table 1.14.2 2021-09-27 [1] CRAN (R 4.2.1)
DBI 1.1.3 2022-06-18 [1] CRAN (R 4.2.1)
dbplyr 2.2.1 2022-06-27 [1] CRAN (R 4.2.1)
deldir 1.0-6 2021-10-23 [1] CRAN (R 4.2.0)
DEoptimR 1.0-11 2022-04-03 [1] CRAN (R 4.2.0)
devtools * 2.4.4 2022-07-20 [1] CRAN (R 4.2.1)
digest 0.6.29 2021-12-01 [1] CRAN (R 4.2.1)
dplyr * 1.0.9 2022-04-28 [1] CRAN (R 4.2.1)
e1071 1.7-11 2022-06-07 [1] CRAN (R 4.2.1)
ellipsis 0.3.2 2021-04-29 [1] CRAN (R 4.2.1)
evaluate 0.16 2022-08-09 [1] CRAN (R 4.2.1)
expm 0.999-6 2021-01-13 [1] CRAN (R 4.2.1)
fansi 1.0.3 2022-03-24 [1] CRAN (R 4.2.1)
farver 2.1.1 2022-07-06 [1] CRAN (R 4.2.1)
fastmap 1.1.0 2021-01-25 [1] CRAN (R 4.2.1)
forcats * 0.5.1 2021-01-27 [1] CRAN (R 4.2.1)
forecast 8.16 2022-01-10 [1] CRAN (R 4.2.1)
foreign 0.8-82 2022-01-16 [1] CRAN (R 4.2.1)
fracdiff 1.5-1 2020-01-24 [1] CRAN (R 4.2.1)
fs 1.5.2 2021-12-08 [1] CRAN (R 4.2.1)
gargle 1.2.0 2021-07-02 [1] CRAN (R 4.2.1)
gdata 2.18.0.1 2022-05-10 [1] CRAN (R 4.2.1)
generics 0.1.3 2022-07-05 [1] CRAN (R 4.2.1)
ggmap * 3.0.0 2019-02-05 [1] CRAN (R 4.2.1)
ggplot2 * 3.3.6 2022-05-03 [1] CRAN (R 4.2.1)
ggpubr * 0.4.0 2020-06-27 [1] CRAN (R 4.2.1)
ggsignif 0.6.3 2021-09-09 [1] CRAN (R 4.2.1)
glue 1.6.2 2022-02-24 [1] CRAN (R 4.2.1)
gmodels 2.18.1.1 2022-05-17 [1] CRAN (R 4.2.1)
googledrive 2.0.0 2021-07-08 [1] CRAN (R 4.2.1)
googlesheets4 1.0.0 2021-07-21 [1] CRAN (R 4.2.1)
gridExtra * 2.3 2017-09-09 [1] CRAN (R 4.2.1)
gtable 0.3.0 2019-03-25 [1] CRAN (R 4.2.1)
gtools 3.9.3 2022-07-11 [1] CRAN (R 4.2.1)
haven 2.5.0 2022-04-15 [1] CRAN (R 4.2.1)
hms 1.1.1 2021-09-26 [1] CRAN (R 4.2.1)
htmltools * 0.5.3 2022-07-18 [1] CRAN (R 4.2.1)
htmlwidgets * 1.5.4 2021-09-08 [1] CRAN (R 4.2.1)
httpuv 1.6.5 2022-01-05 [1] CRAN (R 4.2.1)
httr 1.4.3 2022-05-04 [1] CRAN (R 4.2.1)
intervals 0.15.2 2020-04-04 [1] CRAN (R 4.2.0)
jpeg 0.1-9 2021-07-24 [1] CRAN (R 4.2.0)
jsonlite 1.8.0 2022-02-22 [1] CRAN (R 4.2.1)
KernSmooth 2.23-20 2021-05-03 [1] CRAN (R 4.2.1)
knitr 1.40 2022-08-24 [1] CRAN (R 4.2.1)
labeling 0.4.2 2020-10-20 [1] CRAN (R 4.2.0)
later 1.3.0 2021-08-18 [1] CRAN (R 4.2.1)
lattice 0.20-45 2021-09-22 [1] CRAN (R 4.2.1)
lazyeval 0.2.2 2019-03-15 [1] CRAN (R 4.2.1)
leaflet * 2.1.1 2022-03-23 [1] CRAN (R 4.2.1)
leaflet.providers 1.9.0 2019-11-09 [1] CRAN (R 4.2.1)
LearnBayes 2.15.1 2018-03-18 [1] CRAN (R 4.2.0)
lifecycle 1.0.1 2021-09-24 [1] CRAN (R 4.2.1)
lmtest 0.9-40 2022-03-21 [1] CRAN (R 4.2.1)
lubridate 1.8.0 2021-10-07 [1] CRAN (R 4.2.1)
lwgeom 0.2-8 2021-10-06 [1] CRAN (R 4.2.1)
magrittr 2.0.3 2022-03-30 [1] CRAN (R 4.2.1)
maptools * 1.1-4 2022-04-17 [1] CRAN (R 4.2.1)
MASS 7.3-57 2022-04-22 [1] CRAN (R 4.2.1)
Matrix * 1.4-1 2022-03-23 [1] CRAN (R 4.2.1)
memoise 2.0.1 2021-11-26 [1] CRAN (R 4.2.1)
mgcv 1.8-40 2022-03-29 [1] CRAN (R 4.2.1)
mime 0.12 2021-09-28 [1] CRAN (R 4.2.0)
miniUI 0.1.1.1 2018-05-18 [1] CRAN (R 4.2.1)
modelr 0.1.8 2020-05-19 [1] CRAN (R 4.2.1)
munsell 0.5.0 2018-06-12 [1] CRAN (R 4.2.1)
nlme 3.1-157 2022-03-25 [1] CRAN (R 4.2.1)
nnet 7.3-17 2022-01-16 [1] CRAN (R 4.2.1)
patchwork * 1.1.1 2020-12-17 [1] CRAN (R 4.2.1)
pillar 1.8.0 2022-07-18 [1] CRAN (R 4.2.1)
pkgbuild 1.3.1 2021-12-20 [1] CRAN (R 4.2.1)
pkgconfig 2.0.3 2019-09-22 [1] CRAN (R 4.2.1)
pkgload 1.3.0 2022-06-27 [1] CRAN (R 4.2.1)
plotly * 4.10.0 2021-10-09 [1] CRAN (R 4.2.1)
plyr 1.8.7 2022-03-24 [1] CRAN (R 4.2.1)
png 0.1-7 2013-12-03 [1] CRAN (R 4.2.0)
prettyunits 1.1.1 2020-01-24 [1] CRAN (R 4.2.1)
prism * 0.2.0 2020-12-05 [1] CRAN (R 4.2.1)
processx 3.7.0 2022-07-07 [1] CRAN (R 4.2.1)
profvis 0.3.7 2020-11-02 [1] CRAN (R 4.2.1)
promises 1.2.0.1 2021-02-11 [1] CRAN (R 4.2.1)
proxy 0.4-27 2022-06-09 [1] CRAN (R 4.2.1)
ps 1.7.1 2022-06-18 [1] CRAN (R 4.2.1)
purrr * 0.3.4 2020-04-17 [1] CRAN (R 4.2.1)
quadprog 1.5-8 2019-11-20 [1] CRAN (R 4.2.0)
quantmod 0.4.20 2022-04-29 [1] CRAN (R 4.2.1)
R6 2.5.1 2021-08-19 [1] CRAN (R 4.2.1)
randomcoloR * 1.1.0.1 2019-11-24 [1] CRAN (R 4.2.1)
raster * 3.5-29 2022-08-14 [1] CRAN (R 4.2.1)
RColorBrewer * 1.1-3 2022-04-03 [1] CRAN (R 4.2.0)
Rcpp * 1.0.9 2022-07-08 [1] CRAN (R 4.2.1)
readr * 2.1.2 2022-01-30 [1] CRAN (R 4.2.1)
readxl 1.4.0 2022-03-28 [1] CRAN (R 4.2.1)
remotes 2.4.2 2021-11-30 [1] CRAN (R 4.2.1)
reprex 2.0.1 2021-08-05 [1] CRAN (R 4.2.1)
reshape2 * 1.4.4 2020-04-09 [1] CRAN (R 4.2.1)
rgdal * 1.5-32 2022-05-09 [1] CRAN (R 4.2.1)
RgoogleMaps 1.4.5.3 2020-02-12 [1] CRAN (R 4.2.1)
rjson 0.2.21 2022-01-09 [1] CRAN (R 4.2.0)
rlang 1.0.5 2022-08-31 [1] CRAN (R 4.2.1)
rmarkdown 2.14 2022-04-25 [1] CRAN (R 4.2.1)
robustbase * 0.95-0 2022-04-02 [1] CRAN (R 4.2.1)
rstatix 0.7.0 2021-02-13 [1] CRAN (R 4.2.1)
rstudioapi 0.13 2020-11-12 [1] CRAN (R 4.2.1)
Rtsne 0.16 2022-04-17 [1] CRAN (R 4.2.1)
rvest 1.0.2 2021-10-16 [1] CRAN (R 4.2.1)
s2 1.1.0 2022-07-18 [1] CRAN (R 4.2.1)
scales 1.2.0 2022-04-13 [1] CRAN (R 4.2.1)
sessioninfo 1.2.2 2021-12-06 [1] CRAN (R 4.2.1)
sf * 1.0-8 2022-07-14 [1] CRAN (R 4.2.1)
sfheaders * 0.4.0 2020-12-01 [1] CRAN (R 4.2.1)
shiny 1.7.1 2021-10-02 [1] CRAN (R 4.2.1)
simplevis * 6.3.0 2022-06-07 [1] CRAN (R 4.2.1)
sp * 1.5-0 2022-06-05 [1] CRAN (R 4.2.1)
spatialreg * 1.2-3 2022-04-18 [1] CRAN (R 4.2.1)
spData * 2.0.1 2021-10-14 [1] CRAN (R 4.2.1)
spdep 1.2-4 2022-04-18 [1] CRAN (R 4.2.1)
splitstackshape * 1.4.8 2019-04-21 [1] CRAN (R 4.2.1)
stars * 0.5-6 2022-07-21 [1] CRAN (R 4.2.1)
stringi 1.7.8 2022-07-11 [1] CRAN (R 4.2.1)
stringr * 1.4.1 2022-08-20 [1] CRAN (R 4.2.1)
terra * 1.6-7 2022-08-07 [1] CRAN (R 4.2.1)
tibble * 3.1.7 2022-05-03 [1] CRAN (R 4.2.1)
tidyr * 1.2.0 2022-02-01 [1] CRAN (R 4.2.1)
tidyselect 1.1.2 2022-02-21 [1] CRAN (R 4.2.1)
tidyverse * 1.3.2 2022-07-18 [1] CRAN (R 4.2.1)
timeDate 3043.102 2018-02-21 [1] CRAN (R 4.2.0)
tseries 0.10-51 2022-05-01 [1] CRAN (R 4.2.1)
TTR 0.24.3 2021-12-12 [1] CRAN (R 4.2.1)
tzdb 0.3.0 2022-03-28 [1] CRAN (R 4.2.1)
units 0.8-0 2022-02-05 [1] CRAN (R 4.2.1)
urca 1.3-0 2016-09-06 [1] CRAN (R 4.2.1)
urlchecker 1.0.1 2021-11-30 [1] CRAN (R 4.2.1)
usethis * 2.1.6 2022-05-25 [1] CRAN (R 4.2.1)
utf8 1.2.2 2021-07-24 [1] CRAN (R 4.2.1)
V8 4.2.0 2022-05-14 [1] CRAN (R 4.2.1)
vctrs 0.4.1 2022-04-13 [1] CRAN (R 4.2.1)
viridisLite 0.4.0 2021-04-13 [1] CRAN (R 4.2.1)
weathermetrics * 1.2.2 2016-05-19 [1] CRAN (R 4.2.1)
withr 2.5.0 2022-03-03 [1] CRAN (R 4.2.1)
wk 0.6.0 2022-01-03 [1] CRAN (R 4.2.1)
xfun 0.32 2022-08-10 [1] CRAN (R 4.2.1)
xml2 1.3.3 2021-11-30 [1] CRAN (R 4.2.1)
xtable 1.8-4 2019-04-21 [1] CRAN (R 4.2.1)
xts 0.12.1 2020-09-09 [1] CRAN (R 4.2.1)
yaml 2.3.5 2022-02-21 [1] CRAN (R 4.2.0)
zoo 1.8-10 2022-04-15 [1] CRAN (R 4.2.1)
Обновлять:
Как указал Бен, это не вsessioninfo list, поэтому я попытался загрузить пакетspacetimeверсия1.2-8и он не загружается после отключения всех загруженных пакетов с той же ошибкой:
Error: package or namespace load failed for ‘spacetime’:
package slot missing from signature for generic ‘coerce’
and classes STFDF, RasterBrick
cannot use with duplicate class names (the package may need to be re-installed)
1 ответ
tl;dr вам, вероятно, нужно перезапустить R (не обязательно перезапускать RStudio, вы можете использоватьSession > Restart R, который перезапустит сеанс R в RStudio).
?detachимеет довольно сложное описание того, что не происходит, когда вы отсоединяете пакеты, и советует вам перезапустить R, если вам нужна чистая среда. Это печально, но это так.
Если у пакета есть пространство имен, его отсоединение по умолчанию не приводит к выгрузке пространства имен (и может даже не выполняться при 'unload = TRUE'), а отсоединение, как правило, не приводит к выгрузке любого динамически загружаемого скомпилированного кода (DLL); см. «getLoadedDLLs» и «library.dynam.unload». Кроме того, зарегистрированные методы S3 из пространства имен не будут удалены, а поскольку методы S3 не помечены своим источником при регистрации, в общем случае невозможно безопасно отменить регистрацию методов, связанных с данным пакетом. Если вы используете «библиотеку» для пакета, пространство имен которого загружено, он прикрепляет экспорт уже загруженного пространства имен. Таким образом, отсоединение и повторное присоединение пакета может не обновить некоторые или все компоненты пакета, и это нежелательно. Самый надежный способ полностью отсоединить пакет — перезапустить R.
В более широком смысле, если у вас есть чистый рабочий процесс, вы, как правило, сможете начать новый сеанс R и вернуться к тому, где вы были, без особых хлопот:
- если вам требуется много времени для повторного запуска некоторого кода, вам, вероятно, следует использовать
targetsилиmake(не пакет R!) или какой-либо другой инструмент рабочего процесса, чтобы избежать повторного запуска восходящих шагов. - если вы не можете полагаться на повторный запуск своего кода, чтобы вернуться туда, где вы были, ваш рабочий процесс по своей сути хрупкий/опасный...
Это дает несколько полезных советов по управлению рабочими процессами в R.