Как мне решить конфликт OptionParser и sphinx-build в большом проекте?

Question

У меня большой проект на Python со многими внешними библиотеками, к которым я не хочу прикасаться, и я хочу сгенерировать документацию с помощью sphinx. Моя проблема заключается в том, что всякий раз, когда я выполняю "make html", я получаю эту ошибку:

...
usage: sphinx-build [global_opts] cmd1 [cmd1_opts] [cmd2 [cmd2_opts] ...]
   or: sphinx-build --help [cmd1 cmd2 ...]
   or: sphinx-build --help-commands
   or: sphinx-build cmd --help

error: option -b not recognized
make: *** [html] Fehler 1

Я уже понял, что эта проблема возникает, когда есть OptionParser в некоторых каталогах, которые я хочу документировать ( конфликтует ли OptionParser со сфинксом?). У меня на самом деле есть много скриптов, которые используют OptionParser в этих каталогах и не оборачивают его if __name__ == "__main__": ..., Мой вопрос:

Как я могу сгенерировать документацию, не затрагивая ни один из этих скриптов?

Есть ли способ исключить эти файлы / пути? Я уже пробовал exclude_patterns в моем conf.py, но это не сработало. Я не знаю почему. Есть ли способ отловить эту ошибку?

Обновить

Вопрос оказался setup.py файл в дереве анализируется autodoc,