Как выполнить запрос Гремлина с помощью mogwai
Я пытаюсь запросить Titan DB 0.5.4 через mogwai, но когда я запускаю следующий скрипт, я получаю сообщение об ошибке: rexpro.exceptions.RexProScriptException: транзакция не открыта
и я нашел тот же вопрос здесь
PS нет тега для могвей
сценарий:
#!/usr/bin/env python3
from mogwai.connection import execute_query, setup
con = setup('127.0.0.1', graph_name="bio4j", username="re", password="re")
results = execute_query("2 * a",params={"a":2}, connection= con)
print(results)
results = execute_query("bio4j.E",params={}, connection= con)
print(results)
журнал:
$ ./bin/rexster.sh --start
0 [main] INFO com.tinkerpop.rexster.Application - .:Welcome to Rexster:.
93 [main] INFO com.tinkerpop.rexster.server.RexsterProperties - Using [/Users/Phoenix/Dropbox/Graph4Bio/Titan/rexhome/config/rexster.xml] as configuration source.
102 [main] INFO com.tinkerpop.rexster.Application - Rexster is watching [/Users/Phoenix/Dropbox/Graph4Bio/Titan/rexhome/config/rexster.xml] for change.
730 [main] INFO com.thinkaurelius.titan.graphdb.configuration.GraphDatabaseConfiguration - Generated unique-instance-id=0a69045d1736-AngryMac-local1
804 [main] INFO com.thinkaurelius.titan.diskstorage.Backend - Initiated backend operations thread pool of size 8
905 [main] INFO com.thinkaurelius.titan.diskstorage.log.kcvs.KCVSLog - Loaded unidentified ReadMarker start time Timepoint[1455128079919000 μs] into com.thinkaurelius.titan.diskstorage.log.kcvs.KCVSLog$MessagePuller@302c971f
908 [main] INFO com.tinkerpop.rexster.RexsterApplicationGraph - Graph [bio4j] - configured with allowable namespace [tp:gremlin]
932 [main] INFO com.tinkerpop.rexster.config.GraphConfigurationContainer - Graph bio4j - titangraph[berkeleyje:/Users/Phoenix/Dropbox/Graph4Bio/Bio4j/bio4j] loaded
939 [main] INFO com.tinkerpop.rexster.server.metrics.HttpReporterConfig - Configured HTTP Metric Reporter.
941 [main] INFO com.tinkerpop.rexster.server.metrics.ConsoleReporterConfig - Configured Console Metric Reporter.
2058 [main] INFO com.tinkerpop.rexster.server.HttpRexsterServer - HTTP/REST thread pool configuration: kernal[4 / 4] worker[8 / 8]
2060 [main] INFO com.tinkerpop.rexster.server.HttpRexsterServer - Using org.glassfish.grizzly.strategies.LeaderFollowerNIOStrategy IOStrategy for HTTP/REST.
2160 [main] INFO com.tinkerpop.rexster.server.HttpRexsterServer - Rexster Server running on: [http://localhost:8182]
2160 [main] INFO com.tinkerpop.rexster.server.RexProRexsterServer - Using org.glassfish.grizzly.strategies.LeaderFollowerNIOStrategy IOStrategy for RexPro.
2160 [main] INFO com.tinkerpop.rexster.server.RexProRexsterServer - RexPro thread pool configuration: kernal[4 / 4] worker[8 / 8]
2162 [main] INFO com.tinkerpop.rexster.server.RexProRexsterServer - Rexster configured with [DefaultSecurity].
2163 [main] INFO com.tinkerpop.rexster.server.RexProRexsterServer - RexPro Server bound to [0.0.0.0:8184]
2177 [main] INFO com.tinkerpop.rexster.server.ShutdownManager - Bound shutdown socket to /127.0.0.1:8183. Starting listener thread for shutdown requests.
152568 [Grizzly(2) SelectorRunner] INFO com.tinkerpop.rexster.protocol.EngineController - ScriptEngineManager has factory for: ECMAScript
152568 [Grizzly(2) SelectorRunner] INFO com.tinkerpop.rexster.protocol.EngineController - ScriptEngineManager has factory for: gremlin-groovy
152568 [Grizzly(2) SelectorRunner] INFO com.tinkerpop.rexster.protocol.EngineController - Registered ScriptEngine for: gremlin-groovy
152569 [Grizzly(2) SelectorRunner] INFO com.tinkerpop.rexster.protocol.EngineHolder - Initializing gremlin-groovy engine with additional imports.
153259 [Grizzly(2) SelectorRunner] INFO com.tinkerpop.rexster.protocol.EngineHolder - ScriptEngine initializing with a custom script
154074 [Grizzly(2) SelectorRunner] INFO com.tinkerpop.rexster.protocol.EngineController - ScriptEngineManager has factory for: Groovy
154076 [Grizzly(2) SelectorRunner] INFO com.tinkerpop.rexster.protocol.session.RexProSessions - RexPro Session created: a2b416ce-75ea-4ecb-9835-b287162c90cb
154354 [Grizzly(4)] INFO com.tinkerpop.rexster.protocol.session.RexProSessions - Try to destroy RexPro Session: a2b416ce-75ea-4ecb-9835-b287162c90cb
154355 [Grizzly(4)] INFO com.tinkerpop.rexster.protocol.session.RexProSessions - RexPro Session destroyed or doesn't otherwise exist: a2b416ce-75ea-4ecb-9835-b287162c90cb
154356 [Grizzly(5)] INFO com.tinkerpop.rexster.protocol.session.RexProSessions - RexPro Session created: 5b8a669f-615d-4f84-9d1e-2d10624347f0
154525 [Grizzly(7)] WARN com.tinkerpop.rexster.protocol.server.ScriptServer - Could not process script [bio4j.E] for language [groovy] on session [[B@6634722f] and request [[B@68f38099]
154527 [Grizzly(8)] INFO com.tinkerpop.rexster.protocol.session.RexProSessions - Try to destroy RexPro Session: 5b8a669f-615d-4f84-9d1e-2d10624347f0
154527 [Grizzly(8)] INFO com.tinkerpop.rexster.protocol.session.RexProSessions - RexPro Session destroyed or doesn't otherwise exist: 5b8a669f-615d-4f84-9d1e-2d10624347f0
154529 [Grizzly(1)] INFO com.tinkerpop.rexster.protocol.session.RexProSessions - Try to destroy RexPro Session: 00000000-0000-0000-0000-000000000000
154529 [Grizzly(1)] INFO com.tinkerpop.rexster.protocol.session.RexProSessions - RexPro Session destroyed or doesn't otherwise exist: 00000000-0000-0000-0000-000000000000
1 ответ
Сопровождающий могваев здесь.
Какую версию mogwai вы используете? в 0.7.7 нет возвращаемого значения для метода установки, и объект соединения не должен передаваться. Фактически, когда вы вызываете setup, он создает пул соединений (синхронный пул соединений rexpro, так как не был указан параметр параллелизма). В общем, просто вызовите setup один раз для жизни вашего приложения, и вы можете использовать запрос на выполнение без каких-либо ссылок.
Также это сообщение особенно выделяется:
154525 [Grizzly(7)] WARN com.tinkerpop.rexster.protocol.server.ScriptServer - Could not process script [bio4j.E] for language [groovy] on session [[B@6634722f] and request [[B@68f38099]
Ваш график настроен с именем графика "bio4j"? Имя титанового графа по умолчанию - "graph", а по умолчанию имя объекта графа, которое использует mogwai - "g". Если у вас есть имя графика "bio4j", вы бы не ссылались на него напрямую, вы бы использовали имя объекта графика, связанное с транзакцией. Вы можете рассматривать имя графа как имя базы данных в базе данных SQL, а объект графа является транзакционной ссылкой на указанную базу данных. Это настраивается в файле конфигурации xml при запуске titan. В частности:
<graphs>
<graph>
<graph-name>graph</graph-name>
....
</graph>
</graphs>
Таким образом, предполагая, что вы изменили это значение с "graph" на "bio4j" и оставили стандартное имя graph_obj_name в функции настройки как "g", тогда ваш запрос должен читать "gE".