ggfortify преобразование prcomp autoplot
При использовании ggfortify и prcomp для определения основных компонентов значения отличаются от тех, которые отображаются позже при использовании автоплота.
Это связано с преобразованием, которое происходит в ggfortify, но я изо всех сил пытаюсь найти подробности того, что это за преобразование. Мне не обязательно знать точную формулу, но, по крайней мере, описание было бы полезно.
На изображении ниже вы увидите: Слева:
pca$x
. Верно:
autoplot(pca)
. Как видите, масштаб изменился, и значения не соответствуют.