Что означает "NEGATIVE_TRAIN_SITE" в VQSR?

Я нигде не могу найти, что означает «NEGATIVE_TRAIN_SITE» в данных VCF после VQSR. (Я искал везде в GATK) Я думал, что это означает, что вариант считается не на сайте истины из-за плохих оценок VQSLOD и должен быть отфильтрован. Однако в моих данных VCF оценка VQSLOD и значение «NEGATIVE_TRAIN_SITE» не соответствует истине или ложности. Что означает этот термин? Спасибо :)

0 ответов

Другие вопросы по тегам