Двухфакторные решетчатые боксплоты в R

Question

Я хотел бы создать решетчатую диаграмму из данных, которые имеют несколько факторов и несколько уровней для каждого фактора.

Для каждого графика на графике решетки я бы хотел, чтобы ось x была комбинацией обоих факторов и их уровней, а ось y - значениями.

Ниже я привел некоторые примеры данных, которые показывают, как я могу создать график решетки для факторов, но не для факторов и их комбинаций уровней. Я не хочу 3D-графики, и я хотел бы использовать boxplots, если это вообще возможно.

library(plyr)
library(reshape2)
library(lattice)

col_t <- c("Factors","Levels",LETTERS[1:10])
data1 <-  rnorm(1000)
dm <- matrix(data1, nrow = 100, ncol = 10, byrow = TRUE)
    df <- data.frame(dm)

 facs <- c(rep("M",25),  rep("N",25),  rep("O",25), rep("P",25))
 levs <- c(rep(c("W","x","Y","Z"),25))   
    df <- cbind(facs,levs,df)
        colnames(df) <-  col_t

dfm <- melt(df, id.vars=c("Factors", "Levels"))
    head(dfm)

# Creates the Lattice plot where the rnorm data is on the y-axis and the A factors are 
# on the x-axis for every Variable in variable    
    All_Graph <- bwplot(value ~ Factors | variable,
                        data=dfm,
                        scales=list(relation="free",x=list(cex=1.1),y=list(cex=1.25)),
                        main= list("All Metric Values", cex=2.5),
                        xlab=list("Treatments", cex=2.5),
                        ylab=list("Metric Value", cex=2.5),
                        do.out = FALSE,
                        col="black",   
                        coef=4
    )
    trel_wid <- 960
    trellis.device(device="png", filename="All Var Plots.png", width= trel_wid, height= trel_wid*1.5)
    print(All_Graph)
    dev.off()  

# Now I'd like to create a plot of each level of each factor. Where the x-axis is A*B 
# and the y-axis is the rnorm data

    All_Graph <- bwplot(value ~ Factors*Levels | variable,
                        data=dfm,
                        scales=list(relation="free",x=list(cex=1.1),y=list(cex=1.25)),
                        main= list("All Metric Values", cex=2.5),
                        xlab=list("Treatments", cex=2.5),
                        ylab=list("Metric Value", cex=2.5),
                        do.out = FALSE,
                        col="black",   
                        coef=4
    )
    trel_wid <- 960
    trellis.device(device="png", filename="All Var+Lev Plots.png", width= trel_wid, height= trel_wid*1.5)
    print(All_Graph)
    dev.off()  

Любые предложения будут огромной помощью!

Answer 1

С помощью Джона я добрался до следующего. GGPlot с Facet_wrap был путь. Это быстрый и простой способ построения многоуровневых решеточных графиков.

library(plyr)
library(reshape2)
library(lattice)

col_t <- c("Factors","Levels",LETTERS[1:10])
data1 <-  rnorm(1000)
dm <- matrix(data1, nrow = 100, ncol = 10, byrow = TRUE)
    df <- data.frame(dm)

 facs <- c(rep("M",25),  rep("N",25),  rep("O",25), rep("P",25))
 levs <- c(rep(c("W","x","Y","Z"),25))   
    df <- cbind(facs,levs,df)
        colnames(df) <-  col_t

dfm <- melt(df, id.vars=c("Factors", "Levels"))
    head(dfm)


    sp <- ggplot(dfm, aes(x=Factors, y=value, fill=Levels)) + 
            geom_boxplot(coef=4, outlier.shape = NA, position = "dodge", alpha = 1, 
                     lwd = 1, fatten = 0.75) 

    sp + facet_wrap(~variable, ncol=3, scales="free")

Answer 2

Используя решетку, вы можете попробовать это:

All_Graph <- bwplot(value ~ Factors : Levels | variable,     # use interaction
                    data=dfm,
                    scales=list(relation="free",x=list(cex=1.1),y=list(cex=1.25)),
                    main= list("All Metric Values", cex=2.5),
                    xlab=list("Treatments", cex=2.5),
                    ylab=list("Metric Value", cex=2.5),
                    do.out = FALSE,
                    col="black",   
                    coef=4
)
trel_wid <- 1500
trellis.device(device="png", filename="All Var+Lev Plots.png", width= trel_wid, height= trel_wid*1.5)
print(All_Graph)
dev.off()  

с выходом