Automake: настроить только подкаталог
Это касается внешнего проекта, в котором были изменены один файл OneLibrary.c и SomeLibraries.am;
Было бы неплохо ./configure --please-configure-only-this-subdirectory=./SomeLibrariesSubdirectory
что-то похожее make -C ./SomeLibrariesSubdirectory
Потому что весь "./configure" занимает 5 минут, когда были изменены только две строки;)