Кнн предсказания с кластеризацией
У меня есть набор данных 60,000 obs/40 Variable, в котором я использовал Clara, в основном из-за ограничений памяти.
library(cluster)
library(dplyr)
mutate(kddnew, Att=ifelse(Class=="normal","normal", "attack"))
ds <- dat[,c(-20,-21,-40)
clus <- clara(ds, 3, samples=500, sampsize=100, pamLike=TRUE)
Это вернуло стол с медоидами.
Сейчас я пытаюсь использовать knn
сделать такой прогноз:
medoidz <- clus$medoids
r <- knn(medoidz, ds, cl=ds$targetvariable)
И это возвращается
"поезд" и "класс" имеют разную длину
Может кто-нибудь, пожалуйста, пролить свет на то, как его использовать?
1 ответ
Решение
Это работает:
require(cluster)
require(class)
data(iris)
ds <- iris
ds$y <- as.numeric(ds$Species)
ds$Species <- NULL
idx <- rbinom(nrow(ds), 2, .6)
training <- ds[idx,]
testing <- ds[-idx,]
x <- training
y <- training$y
x1 <- testing
y1 <- testing$y
clus <- clara(x, 3, samples = 1, sampsize = nrow(x), pamLike=TRUE)
knn(train = x, test = x1, cl = clus$clustering, k = 10, l = 0, prob = T, use.all = T)
Хотя число 3, очевидно, является плохим выбором для числа кластеров в этом наборе данных, поэтому прогноз не очень хороший. Надеемся, что вы выберете правильное количество кластеров для ваших данных, и вы можете проверить свои прогнозы с помощью prediction.strength
из пакета fpc
или другими способами.