Проблемы с маркировкой текста facet_wrap в stat_fit_glance
Мне интересно, почему текст имеет тенденцию к повышению на графиках... он не остается на месте с facet_wrap или facet_grid. На более сложном графике набора данных текст нечитаем из-за перекрытия.
Ниже приведены данные и код для воспроизведения сюжета и выпуска. Добавление geom="text" в stat_fit_glance приводит кError: Discrete value supplied to continuous scale
.
library(ggpmisc)
library(ggplot2)
DF <- data.frame(Site = rep(LETTERS[20:24], each = 4),
Region = rep(LETTERS[14:18], each = 4),
time = rep(LETTERS[1:10], each = 10),
group = rep(LETTERS[1:4], each = 10),
value1 = runif(n = 1000, min = 10, max = 15),
value2 = runif(n = 1000, min = 100, max = 150))
DF$time <- as.numeric(DF$time)
formula1 <- y~x
plot1 <- ggplot(data=DF,
aes(x=time, y= value2,group=Site)) +
geom_point(col="gray", alpha=0.5) +
geom_line(aes(group=Site),col="gray", alpha=0.5) +
geom_smooth(se=F, col="darkorange", alpha=0.8, fill="orange",
method="lm",formula=formula1) +
theme_bw() +
theme(strip.text.x = element_text(size=10),
strip.text.y = element_text(size=10, face="bold", angle=0),
strip.background = element_rect(colour="black", fill="gray90"),
axis.text.x = element_text(size=10), # remove x-axis text
axis.text.y = element_text(size=10), # remove y-axis text
axis.ticks = element_blank(), # remove axis ticks
axis.title.x = element_text(size=18), # remove x-axis labels
axis.title.y = element_text(size=25), # remove y-axis labels
panel.background = element_blank(),
panel.grid.major = element_blank(), #remove major-grid labels
panel.grid.minor = element_blank(), #remove minor-grid labels
plot.background = element_blank()) +
labs(y="", x="Year", title = "")+ facet_wrap(~group)
plot1 + stat_fit_glance(method = "lm", label.x="right", label.y="bottom",
method.args = list(formula = formula1),
aes(label = sprintf('R^2~"="~%.3f~~italic(p)~"="~%.2f',
stat(..r.squared..),stat(..p.value..))),
parse = TRUE)
1 ответ
Когда положение этикеток устанавливается автоматически, npcy
позиция увеличивается для каждого уровня в группирующей переменной. Вы на картеSite
к group
эстетический, как Site
имеет 5 уровней, неравномерно отображаемых в разных аспектах, довольно грубый алгоритм в 'ggpmisc' размещает метки неравномерно: пять строк соответствуют одному каждому из пяти сайтов. Я изменил отображение, чтобы использовать цвет, чтобы это стало более очевидным. Я также удалил весь код, не имеющий отношения к этому вопросу.
plot1 <- ggplot(data=DF,
aes(x=time, y= value2, color=Site)) +
geom_smooth(se=F, alpha=0.8,
method="lm",formula=formula1) +
facet_wrap(~group)
plot1 +
stat_fit_glance(method = "lm", label.x="right", label.y="bottom",
method.args = list(formula = formula1),
aes(label = sprintf('R^2~"="~%.3f~~italic(p)~"="~%.2f',
stat(..r.squared..),stat(..p.value..))),
parse = TRUE) +
expand_limits(y = 110)
Чтобы использовать фиксированные позиции, можно передать координаты npcy, если вы используете значение по умолчанию geom_text_npcy() или передавая координаты данных и используя geom_text(). Каждому уровню группирующего фактора соответствует одна позиция.Site
. Если вектор короче, он перерабатывается. Конечно, чтобы разместить больше меток, вы можете уменьшить размер текста и добавить пространство, расширив область печати. В любом случае на практике вам нужно будет так или иначе указать, какие оценки какой строке соответствуют.
plot1 +
stat_fit_glance(method = "lm", label.x="right", label.y= c(0.01, 0.06, 0.11, 0.01, 0.06),
method.args = list(formula = formula1),
aes(label = sprintf('R^2~"="~%.3f~~italic(p)~"="~%.2f',
stat(..r.squared..),stat(..p.value..))),
parse = TRUE, size = 2.5) +
expand_limits(y = 110)
Примечание: Error: Discrete value supplied to continuous scale
при попытке использовать
geom_text()
это ошибка в ggpmisc, которую я исправил несколько дней назад, но еще не попал в CRAN (будущая версия 0.3.3).