Сортировать Тепловую карту с dplyr

Я работаю над созданием интерактивной тепловой карты Shiny приложение и хотел бы выбрать столбцы для сортировки из выпадающего меню (пример: сортировка "mpg" или "wt" в mtcars от низкого до высокого). Я реализую тепловую карту с d3heatmap пакет и хочу реактивности коротких данных с использованием dplyr, Я получаю следующую ошибку при запуске кода:

Ошибка в eval(заменитель (expr), envir, enclos): недопустимый тип индекса "закрытие"

Я также пытался использовать reactiveValues вместо reactive и включил код в качестве комментария. С использованием reactiveValues Подход я получаю следующую ошибку:

Предупреждение: необработанная ошибка в обозревателе: недопустимый тип индекса "закрытие"

Любая помощь в получении сортировки по тепловой карте будет принята с благодарностью!

app.R

library(ggplot2)
library(d3heatmap)
library(dplyr)
library(shiny)

## ui.R
ui <- fluidPage(
  sidebarPanel(
    h5(strong("Dendrogram:")),
    checkboxInput("cluster_row", "Cluster Rows", value=FALSE),
    checkboxInput("cluster_col", "Cluster Columns", value=FALSE),
    selectInput("sort", "Sort By:", c(names(mtcars),"none"), selected="mpg")
  ),
  mainPanel(
    h4("Heatmap"),
    d3heatmapOutput("heatmap", width = "100%", height="600px") ##
  )
)

## server.R
server <- function(input, output) {

#   values <- reactiveValues(df=mtcars)
#   
#   observe({
#     if(input$sort != "none"){
#       values$df <- arrange(mtcars, input$sort)
#     }else{
#       values$df <- mtcars
#     }
#   })

  df_sort <- reactive({
    df <- mtcars
    if(input$sort != "none"){
      df <- arrange(mtcars, input$sort)
    }else{
      df <- mtcars
    }
  })

  output$heatmap <- renderD3heatmap({
    d3heatmap(df_sort(),
      colors = "Blues",
      if (input$cluster_row) RowV = TRUE else FALSE,
      if (input$cluster_col) ColV = TRUE else FALSE,
      yaxis_font_size = "7px"
    ) 
  })
}

shinyApp(ui = ui, server = server)

1 ответ

Решение

input$sort передается в виде строки символов, поэтому вам нужно использовать arrange_ (см. виньетку на NSE).

Следующее должно сделать трюк:

server <- function(input, output) {
  df_sort <- reactive({
    df <- if(input$sort=='none') mtcars else arrange_(mtcars, input$sort)
  })
  output$heatmap <- renderD3heatmap({
    d3heatmap(
      df_sort(),
      colors = "Blues",
      RowV <- if(input$cluster_row) TRUE else FALSE,
      ColV <- if(input$cluster_col) TRUE else FALSE,
      yaxis_font_size = "7px"
    )
  })
}

ui <- fluidPage(
  sidebarPanel(
    h5(strong("Dendrogram:")),
    checkboxInput("cluster_row", "Cluster Rows", value=FALSE),
    checkboxInput("cluster_col", "Cluster Columns", value=FALSE),
    selectInput("sort", "Sort By:", c(names(mtcars),"none"), selected="mpg")
  ),
  mainPanel(
    h4("Heatmap"),
    d3heatmapOutput("heatmap", width = "100%", height="600px") ##
  )
)
Другие вопросы по тегам