matplotlib: как предотвратить наложение надписей по оси X друг на друга
Я создаю гистограмму с помощью matplotlib. Все это работает хорошо, но я не могу понять, как предотвратить наложение меток оси X друг на друга. Вот пример:
Вот пример SQL для базы данных postgres 9.1:
drop table if exists mytable;
create table mytable(id bigint, version smallint, date_from timestamp without time zone);
insert into mytable(id, version, date_from) values
('4084036', '1', '2006-12-22 22:46:35'),
('4084938', '1', '2006-12-23 16:19:13'),
('4084938', '2', '2006-12-23 16:20:23'),
('4084939', '1', '2006-12-23 16:29:14'),
('4084954', '1', '2006-12-23 16:28:28'),
('4250653', '1', '2007-02-12 21:58:53'),
('4250657', '1', '2007-03-12 21:58:53')
;
И это мой python-скрипт:
# -*- coding: utf-8 -*-
#!/usr/bin/python2.7
import psycopg2
import matplotlib.pyplot as plt
fig = plt.figure()
# for savefig()
import pylab
###
### Connect to database with psycopg2
###
try:
conn_string="dbname='x' user='y' host='z' password='pw'"
print "Connecting to database\n->%s" % (conn_string)
conn = psycopg2.connect(conn_string)
print "Connection to database was established succesfully"
except:
print "Connection to database failed"
###
### Execute SQL query
###
# New cursor method for sql
cur = conn.cursor()
# Execute SQL query. For more than one row use three '"'
try:
cur.execute("""
-- In which year/month have these points been created?
-- Need 'yyyymm' because I only need Months with years (values are summeed up). Without, query returns every day the db has an entry.
SELECT to_char(s.day,'yyyymm') AS month
,count(t.id)::int AS count
FROM (
SELECT generate_series(min(date_from)::date
,max(date_from)::date
,interval '1 day'
)::date AS day
FROM mytable t
) s
LEFT JOIN mytable t ON t.date_from::date = s.day
GROUP BY month
ORDER BY month;
""")
# Return the results of the query. Fetchall() = all rows, fetchone() = first row
records = cur.fetchall()
cur.close()
except:
print "Query could not be executed"
# Unzip the data from the db-query. Order is the same as db-query output
year, count = zip(*records)
###
### Plot (Barchart)
###
# Count the length of the range of the count-values, y-axis-values, position of axis-labels, legend-label
plt.bar(range(len(count)), count, align='center', label='Amount of created/edited points')
# Add database-values to the plot with an offset of 10px/10px
ax = fig.add_subplot(111)
for i,j in zip(year,count):
ax.annotate(str(j), xy=(i,j), xytext=(10,10), textcoords='offset points')
# Rotate x-labels on the x-axis
fig.autofmt_xdate()
# Label-values for x and y axis
plt.xticks(range(len(count)), (year))
# Label x and y axis
plt.xlabel('Year')
plt.ylabel('Amount of created/edited points')
# Locate legend on the plot (http://matplotlib.org/users/legend_guide.html#legend-location)
plt.legend(loc=1)
# Plot-title
plt.title("Amount of created/edited points over time")
# show plot
pylab.show()
Есть ли способ, как я могу предотвратить наложение ярлыков друг на друга? Идеально в автоматическом режиме, потому что я не могу предсказать количество баров.
4 ответа
Редактировать 2014-09-30
Панды теперь имеет read_sql функция. Вы определенно хотите использовать это вместо этого.
Оригинальный ответ
Вот как вы должны преобразовать вашу строку даты в объекты реального времени:
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.dates as mdates
data_tuples = [
('4084036', '1', '2006-12-22 22:46:35'),
('4084938', '1', '2006-12-23 16:19:13'),
('4084938', '2', '2006-12-23 16:20:23'),
('4084939', '1', '2006-12-23 16:29:14'),
('4084954', '1', '2006-12-23 16:28:28'),
('4250653', '1', '2007-02-12 21:58:53'),
('4250657', '1', '2007-03-12 21:58:53')]
datatypes = [('col1', 'i4'), ('col2', 'i4'), ('date', 'S20')]
data = np.array(data_tuples, dtype=datatypes)
col1 = data['col1']
dates = mdates.num2date(mdates.datestr2num(data['date']))
fig, ax1 = plt.subplots()
ax1.bar(dates, col1)
fig.autofmt_xdate()
Получение простого списка кортежей из курсора базы данных должно быть так же просто, как...
data_tuples = []
for row in cursor:
data_tuples.append(row)
Тем не менее, я опубликовал версию функции, которую я использую для непосредственного использования курсоров БД для записи массивов или кадров данных pandas: Как преобразовать результат SQL-запроса в структуру данных PANDAS?
Надеюсь, это тоже поможет.
Я думаю, что вы запутались в нескольких моментах о том, как matplotlib обрабатывает даты.
Вы на самом деле не планируете даты, в данный момент. Вы рисуете на оси X [0,1,2,...] а затем вручную маркировать каждую точку строковым представлением даты.
Matplotlib автоматически установит тики. Однако вы переопределяете функциональность позиционирования тиков в Matplotlib (используя xticks в основном говорит: "Я хочу, чтобы галочки были именно в этих позициях".)
На данный момент вы получите галочки на [10, 20, 30, ...] если matplotlib автоматически позиционирует их. Однако они будут соответствовать значениям, которые вы использовали для построения графика, а не датам (которые вы не использовали при построении графика).
Вы, вероятно, хотите на самом деле построить вещи, используя даты.
В настоящее время вы делаете что-то вроде этого:
import datetime as dt
import matplotlib.dates as mdates
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
# Generate a series of dates (these are in matplotlib's internal date format)
dates = mdates.drange(dt.datetime(2010, 01, 01), dt.datetime(2012,11,01),
dt.timedelta(weeks=3))
# Create some data for the y-axis
counts = np.sin(np.linspace(0, np.pi, dates.size))
# Set up the axes and figure
fig, ax = plt.subplots()
# Make a bar plot, ignoring the date values
ax.bar(np.arange(counts.size), counts, align='center', width=1.0)
# Force matplotlib to place a tick at every bar and label them with the date
datelabels = mdates.num2date(dates) # Go back to a sequence of datetimes...
ax.set(xticks=np.arange(dates.size), xticklabels=datelabels) #Same as plt.xticks
# Make space for and rotate the x-axis tick labels
fig.autofmt_xdate()
plt.show()
Вместо этого попробуйте что-то вроде этого:
import datetime as dt
import matplotlib.dates as mdates
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
# Generate a series of dates (these are in matplotlib's internal date format)
dates = mdates.drange(dt.datetime(2010, 01, 01), dt.datetime(2012,11,01),
dt.timedelta(weeks=3))
# Create some data for the y-axis
counts = np.sin(np.linspace(0, np.pi, dates.size))
# Set up the axes and figure
fig, ax = plt.subplots()
# By default, the bars will have a width of 0.8 (days, in this case) We want
# them quite a bit wider, so we'll make them them the minimum spacing between
# the dates. (To use the exact code below, you'll need to convert your sequence
# of datetimes into matplotlib's float-based date format.
# Use "dates = mdates.date2num(dates)" to convert them.)
width = np.diff(dates).min()
# Make a bar plot. Note that I'm using "dates" directly instead of plotting
# "counts" against x-values of [0,1,2...]
ax.bar(dates, counts, align='center', width=width)
# Tell matplotlib to interpret the x-axis values as dates
ax.xaxis_date()
# Make space for and rotate the x-axis tick labels
fig.autofmt_xdate()
plt.show()
Что касается вашего вопроса о том, как показывать только каждый 4-й тик (например) на xaxis, вы можете сделать это:
import matplotlib.ticker as mticker
myLocator = mticker.MultipleLocator(4)
ax.xaxis.set_major_locator(myLocator)
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
# create a random dataframe with datetimeindex
date_range = pd.date_range('1/1/2011', '4/10/2011', freq='D')
df = pd.DataFrame(np.random.randint(0,10,size=(100, 1)), columns=['value'], index=date_range)
Даты обозначений часто совпадают:
plt.plot(df.index,df['value'])
plt.show()
Поэтому полезно вращать их и выравнивать по правому краю.
fig, ax = plt.subplots()
ax.plot(df.index,df['value'])
ax.xaxis_date() # interpret the x-axis values as dates
fig.autofmt_xdate() # make space for and rotate the x-axis tick labels
plt.show()
