ОШИБКА: неудачная загрузка для пакета 'BiocGenerics'

Я пытаюсь установить этот пакет "BiocGenerics" в R и получаю эту ошибку.

BioC_mirror: https://bioconductor.org/ Использование Bioconductor 3.6 (BiocInstaller 1.28.0), R 3.4.2 (2017-09-28). Установка пакета (ов) "BiocGenerics" с пробным URL " https://bioconductor.org/packages/3.6/bioc/src/contrib/BiocGenerics_0.24.0.tar.gz" Тип контента "application/x-gzip" длиной 43393 байта (42 КБ) ==================================================== === скачал 42 кб

  • установка исходного пакета 'BiocGenerics'... ** R ** inst ** подготовка пакета для отложенной загрузки Создание новой универсальной функции для 'append' в пакете 'BiocGenerics' Создание новой универсальной функции для 'as.data.frame' в пакет 'BiocGenerics' Создание новой универсальной функции для 'cbind' в пакете 'BiocGenerics' Ошибка: идентично (as.call(parse(text = old_code)[[1L]]), body[[7L]][[3L]]) не является ИСТИНОЙ Ошибка в apply_hotfix73465(getGeneric("cbind")): исправление не выполнено для универсальной функции cbind() Ошибка: невозможно загрузить код R в пакете 'BiocGenerics' ОШИБКА: неудачная отложенная загрузка для пакета 'BiocGenerics'
  • удаление "/home/hamna/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/BiocGenerics"

Загруженные исходные пакеты находятся в пути установки '/tmp/RtmprEuKCy/download_packages', недоступны для записи, невозможно обновить пакеты: BiocGenerics, littler, кластер, иностранный, MASS, Matrix, mgcv, nlme, rpart, Surviv Предупреждение: в install.packages(pkgs = do, lib = lib, ...): установка пакета 'BiocGenerics' имела ненулевой статус выхода

Я попытался установить его вручную, но это не удается. И тогда я попробовал эту команду на терминале

sudo apt-get install r-bioc-biocgenerics

Это помогло мне, но он установил более старую версию, которая не подходит для моего окончательного пакета "hgu133plus2.db"

Пожалуйста помоги! Лучший,

1 ответ

На этот вопрос ответили на сайте поддержки Bioconductor.

Существует проблема с версией R 3.4.2, которая требует исправления. Лучшее решение - обновить до версии не ниже 3.4.3.

Другие вопросы по тегам