Проблема PypeR "глобальное имя 'dump_stdout' не определено"

Question

Привет и заранее спасибо.

Я пытаюсь запустить очень простой код на Python, используя модуль PypeR для запуска сценариев R в моем коде Python:

#Writing Some Python Code to interface with R

from pyper import *
import sys
import os
import pandas
import glob
import subprocess
import numpy

outputs = runR("a <- 3; print(a+5)")

Это приводит к следующей ошибке:

Traceback (most recent call last):
  File "C:/Users/gavefl1/Documents/GitHub/Git_R_Test/NewRepo_Python_R/Python_R/MasterFile.py", line 14, in <module>
    outputs = runR("a <- 3; print(a+5)")
  File "C:\Python27\lib\site-packages\pyper.py", line 793, in runR
    Robj = R(RCMD=Robj, max_len=max_len, use_numpy=use_numpy, use_pandas=use_pandas, use_dict=use_dict, host=host, user=user, ssh=ssh, dump_stdout=dump_stdout)
NameError: global name 'dump_stdout' is not defined

Я попытался изучить реальный код PypeR.py, но, насколько я могу судить, определено значение dump_stdout. Мои системные характеристики ниже. Еще раз спасибо

Windows 7 64-битный Python 2.7.8 Visual Studio 2008 (я читал, что это лучший пакет Visual Studio для работы с Python) R 3.1.1 PypeR 1.1.2

Answer 1

Я думаю, что ваш пример пришел отсюда: http://www.jstatsoft.org/v35/c02/paper

Эта статья была опубликована в 2010 году и, скорее всего, соответствует версии 1.0 https://pypi.python.org/pypi/PypeR/1.0

Вы можете установить pyper v.1.0 следующим образом.

pip uninstall pyper
pip install pyper==1.0

При этом вы можете достичь тех же результатов с текущей версией (1.1.2), выполнив следующие действия:

>>> r = R()
>>> outputs = r.("a <- 3; print(a+5)")
>>> outputs
'try({a <- 3; print(a+5)})\n[1] 8\n'

С версией 1.0 результат был:

>>> outputs = runR('a <- 3; print(a+5)')
>>> outputs
'try({a <- 3; print(a+5)})\n[1] 8\n'