Загрузка данных с использованием rJava

Question

Я использую rJava для интеграции Java и R в моем проекте.

Мне нужно загрузить пакет GWmodel R в мое приложение и вычислить матрицу расстояний из Java.

Это моя функция для загрузки GWmodel и расчета матрицы расстояний:

Rengine engine = new Rengine(new String[] { "--no-save" }, false, null);
engine.eval("library(GWmodel)");
engine.eval("data(LondonHP)");
engine.eval("DM <- gw.dist(dp.locat=coordinates(londonhp))");
double[][] matrix = engine.eval("DM").asMatrix();

Но код приводит к ошибке:

Exception in thread "main" java.lang.NullPointerException
    at rjavaexm.RJavaExm.main(RJavaExm.java:30)

Итак, я хочу знать, возможно ли загрузить пакет R и данные, используя rJava из Java, как код выше?

Или есть какие-нибудь подходящие способы сделать это?

Answer 1

Я использую Maven, поэтому у меня есть следующее (сгенерированный из простого проекта Maven)

mvn archetype:generate   -DgroupId=com.test.rserve  -DartifactId=com.test.rserve

Выберите выбор по умолчанию.

pom.xml

<project xmlns="http://maven.apache.org/POM/4.0.0" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance"
  xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 http://maven.apache.org/maven-v4_0_0.xsd">
  <modelVersion>4.0.0</modelVersion>
  <groupId>com.test.rserve</groupId>
  <artifactId>com.test.rserve</artifactId>
  <packaging>jar</packaging>
  <version>1.0-SNAPSHOT</version>
  <name>com.test.rserve</name>
  <url>http://maven.apache.org</url>
  <dependencies>
  <dependency>  
    <groupId>org.rosuda.REngine</groupId>
    <artifactId>Rserve</artifactId>
    <version>1.8.1</version>
    </dependency>    
  </dependencies>
</project>

App.java

package com.test.rserve;

import org.rosuda.REngine.REXP;
import org.rosuda.REngine.REXPMismatchException;
import org.rosuda.REngine.Rserve.RConnection;
import org.rosuda.REngine.Rserve.RserveException;


public class App {

    public static void main(String[] args) throws RserveException,
            REXPMismatchException {
        RConnection c = new RConnection();
        REXP x = c.eval("R.version.string");
        System.out.println(x.asString());   
    c.eval("library(GWmodel)");
    c.eval("data(LondonHP)");
    c.eval("DM <- gw.dist(dp.locat=coordinates(londonhp))");
    REXP y = c.eval("dim(DM)[1]");
    System.out.println(y.asString());
    c.close();
    }
}

Убедитесь, что пакет Rserve установлен в вашей среде R.

от R

library(Rserve)
Rserve()

с Maven (командная строка, другая оболочка)

mvn exec:java -Dexec.mainClass="com.test.rserve.App"

Мы получаем с моими настройками:

R version 3.2.4 (2016-03-16)
316

Не забудьте потом закрыть сервер / процесс Rserve...