Как управлять координатами t, b, l, r функции gtable() для правильного отображения меток и отметок вторичной оси y
Я использую facet_wrap, а также смог построить вспомогательную ось Y. Однако метки не располагаются рядом с осью, скорее они располагаются очень далеко. Я понимаю, что все это будет решено, если я пойму, как манипулировать системой координат gtable (t,b,l,r) гробов. Может ли кто-нибудь объяснить, как и что они на самом деле изображают - т: г = с (4,8,4,4) означает, что.
Существует много ссылок на вторичные яси с ggplot, однако, когда nrow/ncol больше 1, они терпят неудачу. Поэтому, пожалуйста, научите меня основам геометрии сетки и управления местоположением гробов.
Изменить: код
this is the final code written by me :
library(ggplot2)
library(gtable)
library(grid)
library(data.table)
library(scales)
# Data
diamonds$cut <- sample(letters[1:13], nrow(diamonds), replace = TRUE)
dt.diamonds <- as.data.table(diamonds)
d1 <- dt.diamonds[,list(revenue = sum(price),
stones = length(price)),
by=c("clarity", "cut")]
setkey(d1, clarity, cut)
# The facet_wrap plots
p1 <- ggplot(d1, aes(x = clarity, y = revenue, fill = cut)) +
geom_bar(stat = "identity") +
labs(x = "clarity", y = "revenue") +
facet_wrap( ~ cut) +
scale_y_continuous(labels = dollar, expand = c(0, 0)) +
theme(axis.text.x = element_text(angle = 90, hjust = 1),
axis.text.y = element_text(colour = "#4B92DB"),
legend.position = "bottom")
p2 <- ggplot(d1, aes(x = clarity, y = stones, colour = "red")) +
geom_point(size = 4) +
labs(x = "", y = "number of stones") + expand_limits(y = 0) +
scale_y_continuous(labels = comma, expand = c(0, 0)) +
scale_colour_manual(name = '', values = c("red", "green"),
labels = c("Number of Stones"))+
facet_wrap( ~ cut) +
theme(axis.text.y = element_text(colour = "red")) +
theme(panel.background = element_rect(fill = NA),
panel.grid.major = element_blank(),
panel.grid.minor = element_blank(),
panel.border = element_rect(fill = NA, colour = "grey50"),
legend.position = "bottom")
# Get the ggplot grobs
xx <- ggplot_build(p1)
g1 <- ggplot_gtable(xx)
yy <- ggplot_build(p2)
g2 <- ggplot_gtable(yy)
nrow = length(unique(xx$panel$layout$ROW))
ncol = length(unique(xx$panel$layout$COL))
npanel = length(xx$panel$layout$PANEL)
pp <- c(subset(g1$layout, grepl("panel", g1$layout$name), se = t:r))
g <- gtable_add_grob(g1, g2$grobs[grepl("panel", g1$layout$name)],
pp$t, pp$l, pp$b, pp$l)
hinvert_title_grob <- function(grob){
widths <- grob$widths
grob$widths[1] <- widths[3]
grob$widths[3] <- widths[1]
grob$vp[[1]]$layout$widths[1] <- widths[3]
grob$vp[[1]]$layout$widths[3] <- widths[1]
grob$children[[1]]$hjust <- 1 - grob$children[[1]]$hjust
grob$children[[1]]$vjust <- 1 - grob$children[[1]]$vjust
grob$children[[1]]$x <- unit(1, "npc") - grob$children[[1]]$x
grob
}
j = 1
k = 0
for(i in 1:npanel){
if ((i %% ncol == 0) || (i == npanel)){
k = k + 1
index <- which(g2$layout$name == "axis_l-1") # Which grob
yaxis <- g2$grobs[[index]] # Extract the grob
ticks <- yaxis$children[[2]]
ticks$widths <- rev(ticks$widths)
ticks$grobs <- rev(ticks$grobs)
ticks$grobs[[1]]$x <- ticks$grobs[[1]]$x - unit(1, "npc")
ticks$grobs[[2]] <- hinvert_title_grob(ticks$grobs[[2]])
yaxis$children[[2]] <- ticks
if (k == 1)#to ensure just once d secondary axisis printed
g <- gtable_add_cols(g,g2$widths[g2$layout[index,]$l],
max(pp$r[j:i]))
g <- gtable_add_grob(g,yaxis,max(pp$t[j:i]),max(pp$r[j:i])+1,
max(pp$b[j:i])
, max(pp$r[j:i]) + 1, clip = "off", name = "2ndaxis")
j = i + 1
}
}
# inserts the label for 2nd y-axis
loc_1st_yaxis_label <- c(subset(g$layout, grepl("ylab", g$layout$name), se
= t:r))
loc_2nd_yaxis_max_r <- c(subset(g$layout, grepl("2ndaxis", g$layout$name),
se = t:r))
zz <- max(loc_2nd_yaxis_max_r$r)+1
loc_1st_yaxis_label$l <- zz
loc_1st_yaxis_label$r <- zz
index <- which(g2$layout$name == "ylab")
ylab <- g2$grobs[[index]] # Extract that grob
ylab <- hinvert_title_grob(ylab)
ylab$children[[1]]$rot <- ylab$children[[1]]$rot + 180
g <- gtable_add_grob(g, ylab, loc_1st_yaxis_label$t, loc_1st_yaxis_label$l
, loc_1st_yaxis_label$b, loc_1st_yaxis_label$r
, clip = "off", name = "2ndylab")
grid.draw(g)
@Sandy вот код и его вывод
Единственная проблема заключалась в том, что в последнем ряду вторичные метки оси Y находятся внутри панелей. Я пытался решить эту проблему, но не смог
1 ответ
Были проблемы с вашим gtable_add_cols() а также gtable_add_grob() команды. Я добавил комментарии ниже.
Обновлено до ggplot2 v2.2.0
library(ggplot2)
library(gtable)
library(grid)
library(data.table)
library(scales)
diamonds$cut <- sample(letters[1:4], nrow(diamonds), replace = TRUE)
dt.diamonds <- as.data.table(diamonds)
d1 <- dt.diamonds[,list(revenue = sum(price),
stones = length(price)),
by=c("clarity", "cut")]
setkey(d1, clarity, cut)
# The facet_wrap plots
p1 <- ggplot(d1, aes(x = clarity, y = revenue, fill = cut)) +
geom_bar(stat = "identity") +
labs(x = "clarity", y = "revenue") +
facet_wrap( ~ cut, nrow = 2) +
scale_y_continuous(labels = dollar, expand = c(0, 0)) +
theme(axis.text.x = element_text(angle = 90, hjust = 1),
axis.text.y = element_text(colour = "#4B92DB"),
legend.position = "bottom")
p2 <- ggplot(d1, aes(x = clarity, y = stones, colour = "red")) +
geom_point(size = 4) +
labs(x = "", y = "number of stones") + expand_limits(y = 0) +
scale_y_continuous(labels = comma, expand = c(0, 0)) +
scale_colour_manual(name = '', values = c("red", "green"),
labels =c("Number of Stones")) +
facet_wrap( ~ cut, nrow = 2) +
theme(axis.text.y = element_text(colour = "red")) +
theme(panel.background = element_rect(fill = NA),
panel.grid.major = element_blank(),
panel.grid.minor = element_blank(),
panel.border = element_rect(fill = NA, colour = "grey50"),
legend.position = "bottom")
# Get the ggplot grobs
g1 <- ggplotGrob(p1)
g2 <- ggplotGrob(p2)
# Grab the panels from g2 and overlay them onto the panels of g1
pp <- c(subset(g1$layout, grepl("panel", g1$layout$name), select = t:r))
g <- gtable_add_grob(g1, g2$grobs[grepl("panel", g1$layout$name)],
pp$t, pp$l, pp$b, pp$l)
# Function to invert labels
hinvert_title_grob <- function(grob){
widths <- grob$widths
grob$widths[1] <- widths[3]
grob$widths[3] <- widths[1]
grob$vp[[1]]$layout$widths[1] <- widths[3]
grob$vp[[1]]$layout$widths[3] <- widths[1]
grob$children[[1]]$hjust <- 1 - grob$children[[1]]$hjust
grob$children[[1]]$vjust <- 1 - grob$children[[1]]$vjust
grob$children[[1]]$x <- unit(1, "npc") - grob$children[[1]]$x
grob
}
# Get the y label from g2, and invert it
index <- which(g2$layout$name == "ylab-l")
ylab <- g2$grobs[[index]] # Extract that grob
ylab <- hinvert_title_grob(ylab)
# Put the y label into g, to the right of the right-most panel
# Note: Only one column and one y label
g <- gtable_add_cols(g, g2$widths[g2$layout[index, ]$l], pos = max(pp$r))
g <-gtable_add_grob(g,ylab, t = min(pp$t), l = max(pp$r)+1,
b = max(pp$b), r = max(pp$r)+1,
clip = "off", name = "ylab-r")
# Get the y axis from g2, reverse the tick marks and the tick mark labels,
# and invert the tick mark labels
index <- which(g2$layout$name == "axis-l-1-1") # Which grob
yaxis <- g2$grobs[[index]] # Extract the grob
ticks <- yaxis$children[[2]]
ticks$widths <- rev(ticks$widths)
ticks$grobs <- rev(ticks$grobs)
plot_theme <- function(p) {
plyr::defaults(p$theme, theme_get())
}
tml <- plot_theme(p1)$axis.ticks.length # Tick mark length
ticks$grobs[[1]]$x <- ticks$grobs[[1]]$x - unit(1, "npc") + tml
ticks$grobs[[2]] <- hinvert_title_grob(ticks$grobs[[2]])
yaxis$children[[2]] <- ticks
# Put the y axis into g, to the right of the right-most panel
# Note: Only one column, but two y axes - one for each row of the facet_wrap plot
g <- gtable_add_cols(g, g2$widths[g2$layout[index, ]$l], pos = max(pp$r))
nrows = length(unique(pp$t)) # Number of rows
g <- gtable_add_grob(g, rep(list(yaxis), nrows),
t = unique(pp$t), l = max(pp$r)+1,
b = unique(pp$b), r = max(pp$r)+1,
clip = "off", name = paste0("axis-r-", 1:nrows))
# Get the legends
leg1 <- g1$grobs[[which(g1$layout$name == "guide-box")]]
leg2 <- g2$grobs[[which(g2$layout$name == "guide-box")]]
# Combine the legends
g$grobs[[which(g$layout$name == "guide-box")]] <-
gtable:::cbind_gtable(leg1, leg2, "first")
grid.newpage()
grid.draw(g)
SO не является учебным сайтом, и это может навлечь на себя гнев других пользователей SO, но здесь слишком много комментариев.
Нарисуйте график только с одной графической панелью (т.е. без фасетирования),
library(ggplot2)
p <- ggplot(mtcars, aes(x = mpg, y = disp)) + geom_point()
Получите ггплот гроб.
g <- ggplotGrob(p)
Изучите сюжет Гроб:
1) gtable_show_layout() дайте схему gtable макета участка. Большое пространство в середине - это расположение панели сюжета. Столбцы слева и ниже панели содержат оси y и x. И есть поле вокруг всего сюжета. Индексы указывают местоположение каждой ячейки в массиве. Обратите внимание, например, что панель расположена в третьем ряду четвертого столбца.
gtable_show_layout(g)
2) Структура данных. g$layout возвращает фрейм данных, который содержит имена гробов, содержащихся в графике, а также их местоположения в gtable: t, l, b и r (обозначение top, left, right и bottom). Обратите внимание, например, что панель расположена в t=3, l=4, b=3, r=4. Это то же самое расположение панели, которое было получено выше из диаграммы.
g$layout
3) Диаграмма макета пытается дать высоту и ширину строк и столбцов, но они имеют тенденцию перекрываться. Вместо этого используйте g$widths а также g$heights, 1null width and height - это ширина и высота панели графика. Обратите внимание, что 1null - это 3-я высота и 4-я ширина - снова 3 и 4.
Теперь нарисуйте facet_wrap и график facet_grid.
p1 <- ggplot(mtcars, aes(x = mpg, y = disp)) + geom_point() +
facet_wrap(~ carb, nrow = 1)
p2 <- ggplot(mtcars, aes(x = mpg, y = disp)) + geom_point() +
facet_grid(. ~ carb)
g1 <- ggplotGrob(p1)
g2 <- ggplotGrob(p2)
Эти два графика выглядят одинаково, но их таблицы отличаются. Кроме того, имена компонентов grobs различаются.
Часто удобно получить подмножество фрейма данных компоновки, содержащее индексы (т. Е. T, l, b и r) гробов общего типа; сказать все панели.
pp1 <- subset(g1$layout, grepl("panel", g1$layout$name), select = t:r)
pp2 <- subset(g2$layout, grepl("panel", g2$layout$name), select = t:r)
Обратите внимание, например, что все панели находятся в строке 4 (pp1$t, pp2$t).pp1$r относится к столбцам, которые содержат панели графика;pp1$r + 1 относится к столбцам справа от панелей;max(pp1$r) относится к самому правому столбцу, который содержит панель;max(pp1$r) + 1 относится к столбцу справа от самого правого столбца, который содержит панель;
и так далее.
Наконец, нарисуйте график facet_wrap с более чем одной строкой.
p3 <- ggplot(mtcars, aes(x = mpg, y = disp)) + geom_point() +
facet_wrap(~ carb, nrow = 2)
g3 <- ggplotGrob(p3)
Исследуйте график, как и раньше, но также добавьте фрейм данных макета, чтобы он содержал индексы панелей.
pp3 <- subset(g3$layout, grepl("panel", g3$layout$name), select = t:r)
Как и следовало ожидать, pp3 говорит вам, что панели графика расположены в трех столбцах (4, 7 и 10) и двух рядах (4 и 8).
Эти индексы используются при добавлении строк или столбцов в gtable и при добавлении grobs в gtable. Проверьте эти команды с ?gtable_add_rows а также gtable_add_grob,
Кроме того, узнать некоторые gridособенно о том, как создавать гробов и использовать юниты (некоторые ресурсы приведены в r-grid отметьте здесь на SO.