Предоставить пользовательский список класса от C++ до R через модули Rcpp
Я написал класс class_A на C++ и использую инфраструктуру модулей Rcpp, чтобы представить его R. Работает как шарм.
#include "Rcpp.h"
using namespace Rcpp;
class class_A {
public:
class_A(double num){this->num = num;};
double get_num(){return this->num;};
private:
double num;
};
RCPP_MODULE(class_A_module) {
class_<class_A>("class_A")
.constructor<double>()
.property("num", &class_A::get_num)
;
}
RCPP_EXPOSED_CLASS(class_A);
Теперь я хотел бы иметь класс class_B, который может хранить несколько экземпляров class_A (и некоторые другие атрибуты). Моя идея заключалась в том, чтобы использовать std::vector для этой цели:
class class_B {
public:
class_B(std::vector<class_A> num_list){this->num_list = num_list;};
std::vector<class_A> get_num_list(){return this->num_list;};
private:
std::vector<class_A> num_list;
};
RCPP_MODULE(class_B_module) {
class_<class_B>("class_B")
.constructor<std::vector<class_A>>()
.property("num_list", &class_B::get_num_list)
;
}
RCPP_EXPOSED_CLASS(class_B);
Это не компилируется:
no matching function for call to 'export_range__dispatch(SEXPREC*&,
__gnu_cxx::__normal_iterator<class_A*, std::vector<class_A>
>&, Rcpp::traits::r_type_traits<class_A>::r_category)'
Это не удивительно: как Rcpp должен выставлять std::vector для R?
Из этого весьма актуального потока рассылки rcpp-devel я понял, что тем не менее возможно создать этот простой класс хранения class_B. Я думаю, я должен написать свой собственный wrap
а также as
реализация.
1. Это правильно до сих пор?
2. Как мне это сделать в случае моего простого примера кода? Все примеры, которые я обнаружил, намного сложнее, чем я ожидаю, когда потребуется минимальная реализация.
Изменить: я изменил свой пример кода и попытался точно определить проблему.
Заголовок и реализация теперь разделены:
ex.h
class class_A {
public:
class_A(double num);
double get_num();
private:
double num;
};
class class_B {
public:
class_B(std::vector<class_A> num_list);
std::vector<class_A> get_num_list();
private:
std::vector<class_A> num_list;
};
ex.cpp
#include "Rcpp.h"
#include "ex.h"
using namespace Rcpp;
class_A::class_A(double num){this->num = num;}
double class_A::get_num(){return this->num;}
RCPP_MODULE(class_A_module) {
class_<class_A>("class_A")
.constructor<double>()
.property("num", &class_A::get_num)
;
}
RCPP_EXPOSED_CLASS(class_A);
class_B::class_B(std::vector<class_A> num_list){this->num_list = num_list;}
std::vector<class_A> class_B::get_num_list(){return this->num_list;}
RCPP_MODULE(class_B_module) {
class_<class_B>("class_B")
.constructor<std::vector<class_A>>()
.property("num_list", &class_B::get_num_list)
;
}
RCPP_EXPOSED_CLASS(class_B);
Вот моя попытка реализовать "обтекание" и "как".
fix.cpp
#include <RcppCommon.h>
#include "ex.h"
// non-intrusive extension via template specialisation
namespace Rcpp {
template <> class_A as(SEXP aa);
template <> SEXP wrap(const class_A &a);
template <> class_B as(SEXP bb);
template <> SEXP wrap(const class_B &b);
}
#include <Rcpp.h>
// define template specialisations for as and wrap
namespace Rcpp {
template <> class_A as(SEXP aasexp) {
double aa = as<double>(aasexp);
return class_A(aa);
}
template <> SEXP wrap(const class_A &a) {
return Rcpp::wrap(a);
}
template <> class_B as(SEXP bbsexp) {
// ?
}
template <> SEXP wrap(const class_B &b) {
// ?
}
}
Я думаю, интересные части - это те, которые я не могу понять?
1 ответ
Одним из способов было бы иметь конструктор, принимающий Rcpp::List
или фабрика, если вы не хотите связываться с семантикой class_B
:
class_B* class_B_ctor( List data){
std::vector<class_A> v ;
for( int i=0; i<data.size(); i++){
v.push_back( as<class_A>(data[i]) );
}
return new class_B(v) ;
}
Что вы можете использовать с .factory
метод в вашем модуле:
RCPP_MODULE(class_A_module) {
class_<class_A>("class_A")
.constructor<double>()
.property("num", &class_A::get_num)
;
class_<class_B>("class_B")
.factory< List >( &class_B_ctor )
.property("num_list", &class_B::get_num_list)
;
}
чтобы:
> a1 <- new( class_A )
> a2 <- new( class_B )
> a1
C++ object <0x103008b78> of class 'class_A' <0x10e4bcd20>
> a2
C++ object <0x103008b78> of class 'class_B' <0x10e4bce20>
> new( class_B, list(a1,a2) )
C++ object <0x10e4de420> of class 'class_B' <0x10e4bce20>