Ошибка с pyarrow при загрузке файла паркета, где индекс имеет избыточный столбец
Я использую pandas/dask для выполнения вычислений, и я храню свои данные в файле паркета на диске. Проблема в том, что у меня есть столбец "время", а также индекс, который называется время. Я хочу оставить оба. Когда я сохраняю данные, а затем загружаю их позже, я получаю следующие ошибки:
import pyarrow as pa
import pyarrow.parquet as pq
%matplotlib inline
dfx.to_dict()
Out[115]:
{'close': {Timestamp('2017-06-30 01:31:00'): 154.99958999999998,
Timestamp('2017-06-30 01:32:00'): 154.99958999999998,
Timestamp('2017-06-30 01:33:00'): 154.01109,
Timestamp('2017-06-30 01:34:00'): 154.01109,
Timestamp('2017-06-30 01:35:00'): 152.60051000000001},
'time': {Timestamp('2017-06-30 01:31:00'): Timestamp('2017-06-30 01:31:00'),
Timestamp('2017-06-30 01:32:00'): Timestamp('2017-06-30 01:32:00'),
Timestamp('2017-06-30 01:33:00'): Timestamp('2017-06-30 01:33:00'),
Timestamp('2017-06-30 01:34:00'): Timestamp('2017-06-30 01:34:00'),
Timestamp('2017-06-30 01:35:00'): Timestamp('2017-06-30 01:35:00')}}
# set index column
dfx.set_index('time', drop=False, inplace=True)
dfx.head()
Out[117]:
time close
time
2017-06-30 01:31:00 2017-06-30 01:31:00 154.99959
2017-06-30 01:32:00 2017-06-30 01:32:00 154.99959
2017-06-30 01:33:00 2017-06-30 01:33:00 154.01109
2017-06-30 01:34:00 2017-06-30 01:34:00 154.01109
2017-06-30 01:35:00 2017-06-30 01:35:00 152.60051
# store to parquet file format
tdfx = pa.Table.from_pandas(dfx)
pq.write_table(tdfx, 'data.parquet' )
# recovering
dfx = pq.read_table('data.parquet').to_pandas()
---------------------------------------------------------------------------
IndexError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-119-5e9d7cd2ea0d> in <module>()
1 # recovering
----> 2 dfx = pq.read_table('data.parquet').to_pandas()
pyarrow/table.pxi in pyarrow.lib.Table.to_pandas (/arrow/python/build/temp.linux-x86_64-3.6/lib.cxx:37990)()
/home/ghildebrand/anaconda3/envs/p36/lib/python3.6/site-packages/pyarrow/pandas_compat.py in table_to_blockmanager(options, table, memory_pool, nthreads)
296 i = schema.get_field_index(name)
297 if i != -1:
--> 298 col = table.column(i)
299 index_name = (None if is_unnamed_index_level(name)
300 else name)
pyarrow/table.pxi in pyarrow.lib.Table.column (/arrow/python/build/temp.linux-x86_64-3.6/lib.cxx:38622)()
IndexError: Table column index 2 is out of range
Это ошибка в pyarrow, или это невозможно с паркетом, или я делаю что-то еще не так??
Обновление: удаление лишнего столбца "время" и сохранение только индекса решает. Так что я думаю, проблема в том, что где-то в паркете создаются уникальные наборы идентификаторов столбцов или около того.
1 ответ
Решение
Выглядит немного глючно для меня. Я открыл отчет об ошибке https://issues.apache.org/jira/browse/ARROW-1754, давайте продолжим обсуждение там.