FHIR JSON для XML-декодирования в BizTalk

Question

Я только начинаю с FHIR и с json, поэтому мой вопрос может быть задан не очень хорошо.

Я создал компонент конвейера BizTalk для преобразования FHIR-json в FHIR-xml с помощью этой библиотеки https://github.com/ewoutkramer/fhir-net-api, основываясь на примере, который я нашел здесь, http: // soapfault. ком / блог / 2016/08 / HL7-fhir-JSON-декодирования-в-BizTalk /

Вот фрагмент кода из компонента конвейера. Это почти идентично примеру.

//Read the json message
                        using (TextReader tr = new StreamReader(originalDataStream))
                        {
                            json = tr.ReadToEnd();
                        }

                        //Use FHIR-NET-API to create a FHIR resource from the json
                        Hl7.Fhir.Serialization.ResourceReader resourceReader = new Hl7.Fhir.Serialization.ResourceReader(FhirJsonParser.CreateFhirReader(json), ParserSettings.Default);

                        //Use FHIR-NET-API to serialize the resource to XML
                        byte[] resourceXmlBytes = Hl7.Fhir.Serialization.FhirSerializer.SerializeToXmlBytes(resourceReader.Deserialize());

Компонент конвейера может декодировать любое одиночное сообщение JSON FHIR, начинающееся с { "resourceType": "ImagingStudy",

но я получаю сообщение об ошибке в сообщениях, которые начинаются так,

{
  "resourceType" : "Bundle",
  "entry" : [{
      "resource" : {
        "resourceType" : "ImagingStudy",

или же

{
  "entry": [
    {
      "fullUrl":     "http://fhirtest.uhn.ca/baseDstu2/ImagingStudy/EXexample",
      "resource": {
        "resourceType": "ImagingStudy",

Вот пара ошибок, которые я получил,

There was a failure executing the receive pipeline: "LALALA.Imaging.Pipelines.FHIRJasonDecoderRP, LALALA.Imaging.Pipelines, Version=1.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=19bb8b5ea64396aa" Source: "FHIRJsonDecoder" Receive Port: "RP_LA_Test_FILE" URI: "D:\Projects\LALALA.Imaging\In\*.json" Reason: Data at the root level is invalid. Line 1, position 1.

ИЛИ ЖЕ

Reason: At line 1, pos 1: Cannot determine type of resource to create from json input data: no member resourceType was found

Для моего решения конечная цель состоит в том, чтобы иметь возможность разбирать пакеты сообщений FHIR для изучения изображений в отдельные сообщения fhir xml, которые затем будут отображаться в сообщениях ORU HL7.

Будем весьма благодарны за любую помощь по вышеуказанному вопросу или предложения по достижению моей конечной цели с помощью BizTalk.

Answer 1

Как правило, нет необходимости вызывать ResourceReader напрямую, тем не менее я попытался воспроизвести вашу ошибку следующим образом:

var json = @"{
            ""resourceType"" : ""Bundle"",
            ""entry"" : [{
                  ""resource"" : {
                       ""resourceType"" : ""ImagingStudy""
                                       }}]}";

// SHORT VERSION: var b = new FhirJsonParser().Parse<Bundle>(json);
var b = new     
             Hl7.Fhir.Serialization.ResourceReader(
               FhirJsonParser.CreateFhirReader(json),  
                          ParserSettings.Default).Deserialize();

Assert.IsNotNull(b);

Оба работают нормально, однако. Может быть, что-то идет не так при чтении потока?

Вы также можете попробовать читать прямо из потока:

var b = new FhirJsonParser().Parse<Bundle>(new 
                     Newtonsoft.Json.JsonTextReader(stream));