Посев пользовательского генератора случайных чисел в R
У меня возникли проблемы с заполнением пользовательского RNG в R. Кажется, что
set.seed(123, kind='user', normal.kind='user')
На самом деле не проходит 123
пользователь определил инициализацию RNG.
Я вернулся к документации, доступной на ?Random.user
и попробовал приведенный там пример кода с незначительной модификацией, которую я распечатаю user_unif_init
функция (полный код ниже).
Действия по воспроизведению:
- Вставьте код ниже в
urand.c
- Бежать
R CMD SHLIB urand.c
- открыто
R
Запустите следующие команды:
> dyn.load('urand.so') > set.seed(123, kind='user', normal.kind='user') Received seed: 720453763 Received seed: 303482705 // any other numbers than 123
Вот полный код, который я использовал в urand.c
:
// ## Marsaglia's congruential PRNG
#include <stdio.h>
#include <R_ext/Random.h>
static Int32 seed;
static double res;
static int nseed = 1;
double * user_unif_rand()
{
seed = 69069 * seed + 1;
res = seed * 2.32830643653869e-10;
return &res;
}
void user_unif_init(Int32 seed_in) {
printf("Received seed: %u\n", seed_in);
seed = seed_in;
}
int * user_unif_nseed() { return &nseed; }
int * user_unif_seedloc() { return (int *) &seed; }
/* ratio-of-uniforms for normal */
#include <math.h>
static double x;
double * user_norm_rand()
{
double u, v, z;
do {
u = unif_rand();
v = 0.857764 * (2. * unif_rand() - 1);
x = v/u; z = 0.25 * x * x;
if (z < 1. - u) break;
if (z > 0.259/u + 0.35) continue;
} while (z > -log(u));
return &x;
}
Любая помощь будет принята с благодарностью!
2 ответа
Похоже, что R скремблирует предоставленное пользователем семя в RNG.c
следующее:
for(j = 0; j < 50; j++)
seed = (69069 * seed + 1)
Попытка расшифровать это было бы способом вернуть оригинальное семя.
ОБНОВИТЬ
Расшифровка может быть выполнена с помощью обратного умножения 69069 следующим образом:
Int32 unscramble(Int32 scrambled)
{
int j;
Int32 u = scrambled;
for (j=0; j<50; j++) {
u = ((u - 1) * 2783094533);
}
return u;
}
Подключая это в моем user_unif_init()
Функция решает проблему.
Начальное число, которое передается в ГСЧ, отличается от предоставленного начального числа, однако оно воспроизводимо при использовании "нормального" рабочего процесса. Это тогда дает воспроизводимые случайные числа:
dyn.load('urand.so')
RNGkind("user", "user")
#> Received seed: 1844983443
set.seed(123)
#> Received seed: 303482705
runif(10)
#> [1] 0.42061954 0.77097033 0.14981063 0.27065365 0.77665767 0.96882090
#> [7] 0.49077135 0.08621131 0.52903479 0.90398294
set.seed(123)
#> Received seed: 303482705
runif(10)
#> [1] 0.42061954 0.77097033 0.14981063 0.27065365 0.77665767 0.96882090
#> [7] 0.49077135 0.08621131 0.52903479 0.90398294
(Обратите внимание, что я изменил ваш urand.c
немного использовать Rprintf
от R_ext/Print.h
.)
Изменить: Если вам нужен контроль над семенем (почему?), Чем вы можете сделать это самостоятельно: заменить user_unif_init
, user_unif_nseed
а также user_unif_seedloc
с
void set_seed(int * seed_in) {
Rprintf("Received seed: %u\n", *seed_in);
seed = *seed_in;
}
И назовите это явно:
dyn.load('urand.so')
RNGkind("user", "user")
set_seed <- function(seed) {
invisible(.C("set_seed", seed_in = as.integer(seed)))
}
set_seed(123)
#> Received seed: 123
runif(10)
#> [1] 0.00197801 0.61916849 0.34846373 0.04152509 0.09669026 0.29923760
#> [7] 0.04184693 0.32557942 0.44473242 0.22339845
set_seed(123)
#> Received seed: 123
runif(10)
#> [1] 0.00197801 0.61916849 0.34846373 0.04152509 0.09669026 0.29923760
#> [7] 0.04184693 0.32557942 0.44473242 0.22339845
Изменить 2: Посмотрите на источник по адресу https://svn.r-project.org/R/trunk/src/main/RNG.c:
static void RNG_Init(RNGtype kind, Int32 seed)
{
int j;
BM_norm_keep = 0.0; /* zap Box-Muller history */
/* Initial scrambling */
for(j = 0; j < 50; j++)
seed = (69069 * seed + 1);
[...]
Эти 50 раундов LCG несут ответственность за разницу. Я предполагаю, что авторы R предполагают, что типичные семена, поставляемые пользователем, малы и, следовательно, не достаточно случайны для семян.