Где находится файл сценария.R на ПК?

Question

Я хочу найти расположение файлов скрипта.R, которые используются для вычисления в R.

Я знаю, что, набрав объектную функцию, я получу код, который выполняется, а затем я могу скопировать, отредактировать и сохранить его как новый файл сценария и использовать его.

Причиной запроса на поиск файла foo.R является

1. Любопытство
2. Знать, какой алгоритм используется в численных расчетах
3. Более того, функция из пакета статистики, которую я использую, запускает результаты для двух аргументов, а не для других, и должна выяснить, как заставить ее работать. Ошибка, обозначенная буквой R, подразумевает, что в файле скрипта могут потребоваться некоторые изменения.

Я ищу более общий ответ, если это возможно.

Редактировать: Согласно комментариям, здесь приведен код для вычисления спектра временного ряда с использованием методов авторегрессии. Ввод данных представляет собой одномерный ряд.

x = ts(data)
spec.ar(x, method = "yule-walker")    1
spec.ar(x, method = "burg")        2

Команда 1 работает нормально. Команда 2 дает следующую ошибку.

Error in ar.burg.default(x, aic = aic, order.max = order.max, na.action = na.action,  : 
  Burg's algorithm only implemented for univariate series

Я попытался указать все аргументы правильно, как na.action=na.fail, order.max = NULL и т. Д., Но сообщение то же самое. Пожалуйста, предложите возможные решения.

PS (Этот вопрос задается после поиска в папке библиотеки, в которой установлен R, и zip-файлах, которые поставляются с пакетами, руководствами и открытием файлов.rdb, .rdx)

Answer 1

См. FAQ 7.40 Как получить доступ к исходному коду для функции?

В большинстве случаев при вводе имени функции будет напечатан ее исходный код. Однако код иногда скрывается в пространстве имен или компилируется. Для полного обзора того, как получить доступ к исходному коду, см. Uwe Ligges (2006), "Help Desk: Доступ к источникам", R News, 6/4, 43–45 (http://cran.r-project.org/ DOC /Rnews/Rnews_2006-4.pdf).

Answer 2

Когда R устанавливает пакет, он оценивает все исходные файлы ".R" и повторно сохраняет их в двоичном формате для быстрой загрузки. Поэтому вы обычно не можете легко найти исходный файл.

Как было предложено в другом месте, вы можете просто ввести имя функции и посмотреть исходный код, или скачать пакет с исходным кодом и найти его там.

library(plyr)
ddply # prints the source for ddply

# See the content of the R directory for plyr,
# but it's only binary files:
dir(file.path(find.package("plyr"), "R"))
# [1] "plyr"     "plyr.rdb" "plyr.rdx"

# Get the source for the package:
download.packages("plyr", "~", type="source")

# ...then unpack and inspect the R directory...

Answer 3

Я думаю, что вы просите посмотреть, что я называю исходным кодом для функции в пакете. Если так, то я поступаю следующим образом, что успешно сработало для меня три раза, когда я пытался. Я держу эти инструкции под рукой в ​​нескольких местах и ​​просто скопировал и вставил их здесь:

Чтобы увидеть исходный код функции в программе R, загрузите пакет, содержащий функцию. В частности, загрузите файл, который заканчивается на "tar.gz". Это сжатый файл. Разверните сжатый файл, используя, например, "WinZip". Теперь вам нужно открыть несжатый файл, который заканчивается на ".tar". Загрузите бесплатное программное обеспечение "7-Zip". Нажмите на файл "7zFM.exe" и перейдите в каталог, содержащий файл ".tar". Вы можете извлечь содержимое этого ".tar" файла в новую папку. Содержимое состоит из файлов R, показывающих исходный код для функций в пакете R.

РЕДАКТИРОВАТЬ:

Сегодня (8 июля 2012 г.) я смог открыть файл tar.gz, используя последнюю версию WinZIP, и мог скопировать содержимое (исходный код) оттуда, не используя 7-Zip.

РЕДАКТИРОВАТЬ:

Сегодня (19 января 2013 г.) я просмотрел исходный код для функций в базе R, загрузив файл 'R-2.15.2.tar.gz'

Чтобы загрузить этот файл, перейдите на веб-страницу http://cran.at.r-project.org/ и щелкните этот файл в следующей строке:

"Последний выпуск (2012-10-26, Trick or Treat): R-2.15.2.tar.gz, прочитайте, что нового в последней версии".

Распакуйте файл. WinZip будет работать, или он сделал для меня. Затем найдите на своем компьютере readtable.r или другая базовая функция R.

agstudy отметил здесь https://stackru.com/questions/14417214/source-file-for-r-function что исходный код для read.csv находится в файле readtable.r, поэтому не ожидайте, что каждая базовая функция R будет иметь свой собственный файл.

Answer 4

.libPaths() должен рассказать вам все ваши текущие местоположения библиотеки. Можно иметь более одной установки пакета, если есть две библиотеки, но будет использоваться только та, которая находится в первой библиотеке. Если вы не предложите код и точное сообщение об ошибке, вряд ли кто-то сможет предложить лучший совет.