Как рассчитать количество ребер между узлами определенной группы?
У меня есть следующий набор данных и следующий скрипт:
library(GGally)
library(ggnet)
library(network)
library(sna)
library(ggplot2)
# edgelist
e <- data.frame(sender = c(1, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 3, 3, 3, 3, 4, 4, 5),
receiver = c(2, 3, 4, 5, 1, 3, 1, 1, 2, 2, 4, 3, 2, 4))
# information about the nodes (vertices)
v <- data.frame(actors = c(1, 2, 3, 4, 5),
groups = c("A", "A", "B", "C", "D"))
net <- network(e, directed = TRUE)
x = data.frame(actors = network.vertex.names(net))
x = merge(x, v, by = "actors", sort = FALSE)$groups
net %v% "group" = as.character(x)
y = RColorBrewer::brewer.pal(9, "Set1")[ c(3, 1, 9, 6, 8) ]
names(y) = levels(x)
ggnet2(net, color = "group", palette = y, alpha = 0.75, size = 4, edge.alpha = 0.5, arrow.size = 8, arrow.gap = 0.01)
Существует ли простой и быстрый способ вычисления количества ребер от группы узлов (A, B, C, D) до той же группы узлов или другой группы узлов (т. Е. От AA, AB, AC, AD, БА и тд)?
Есть network.edgecount
в network-Package
, Но как я могу применить это к моему вопросу?
1 ответ
Решение
mixingmatrix
функция от network
делает трюк. Он отображает количество связей внутри и между группами, получая гомофильное и вспомогательное смешение.
> mixingmatrix(net, "group")
To
From A B C D Total
A 3 2 1 1 7
B 3 0 1 0 4
C 1 1 0 0 2
D 0 0 1 0 1
Total 7 3 3 1 14