Пользовательская группа означает функцию для ggpairs
Согласно документации функции ggpairs() в пакете GGally R, можно указывать пользовательские функции в качестве входных данных для аргумента "lower"/"upper". Для непрерывно-дискретных комбинаций переменных я хотел бы просто отобразить средние значения непрерывной переменной в категориях категориальной переменной (предпочтительно с использованием точек, а не столбцов), если это возможно, дополнительно стратифицировать с помощью другой категориальной переменной с использованием эстетики цвета.
Я нашел некоторую информацию в следующей теме:
https://github.com/ggobi/ggally/issues/218
Однако мои знания о ggpairs (и ggplot2) слишком поверхностны, чтобы можно было создать такую пользовательскую функцию из шаблона в потоке (также, как представляется, имя переменной "Species" жестко запрограммировано в шаблоне, и я бы предпочел, чтобы не иметь никакой жестко закодированной информации в пользовательской функции, если это вообще возможно).
Я был бы очень признателен, если бы кто-нибудь мог помочь мне с шаблоном или эскизом решения, например, используя следующий пример (где "custom_function" необходимо заменить на функцию, описанную выше):
dat <- reshape::tips
pm <- ggpairs(dat,
mapping = aes(color = sex, alpha = 0.3),
columns = c("total_bill", "smoker", "time", "tip"),
showStrips = T,
lower = list(combo = custom_function))
print(pm)
1 ответ
Основываясь на комментарии @aosmith, я сделал пользовательскую функцию, которая, кажется, работает достаточно хорошо для моих целей, до сих пор не тестировал ее всесторонне, но, возможно, она все равно полезна:
library(GGally)
library(ggplot2)
library(ggstance)
gmean_point <- function(data, mapping, ...) {
x <- eval(mapping$x, data)
y <- eval(mapping$y, data)
if(is.numeric(y)) {
p <- ggplot(data) +
geom_blank(mapping) +
stat_summary(mapping,
geom = 'point', fun.y = mean,
position = position_dodge(width = 0.2))
} else {
p <- ggplot(data) +
geom_blank(mapping) +
stat_summaryh(mapping,
geom = 'point', fun.x = mean,
position = position_dodgev(height = 0.2))
}
p
}
pm <- ggpairs(reshape::tips,
mapping = aes(color = sex, alpha = 0.3),
columns = c("total_bill", "smoker", "time", "tip"),
showStrips = T,
lower = list(combo = gmean_point),
upper = list(combo = 'box'))
print(pm)