Таблица техрегов для воздействий пространственной модели запаздывания
Я использую spdep
запустить пространственную регрессию с использованием модели запаздывания Дурбина. Этот тип модели возвращает прямые, косвенные и суммарные эффекты для каждого коэффициента регрессии и их уровня значимости.
Есть R
библиотека как texreg
это хорошо организовывает вывод модели запаздывания Дурбина с информацией о прямых, косвенных и полных эффектах?
Воспроизводимый пример:
library(spdep)
example(columbus)
listw <- nb2listw(col.gal.nb)
# spatial regression - Durbin Model
mobj <- lagsarlm(CRIME ~ INC + HOVAL, columbus, listw, type="mixed")
summary(mobj)
# Calculate direct and indirect impacts
W <- as(listw, "CsparseMatrix")
trMatc <- trW(W, type="mult")
trMC <- trW(W, type="MC")
imp <- impacts(mobj, tr=trMC, R=100)
sums <- summary(imp, zstats=T)
# Return Effects
data.frame(sums$res)
# Return p-values
data.frame(sums$pzmat)
1 ответ
Я не уверен, существует ли существующая функция для создания красивой таблицы для этого типа объекта модели, но (с некоторыми усилиями) вы можете свернуть свою собственную.
Ниже rmarkdown
документ с вашим кодом плюс три дополнительных блока кода. Первый объединяет данные коэффициента и p-значения. Следующие два генерируют два разных варианта latex
столы.
я использовал sums$res
а также sums$pzmat
для табличных значений, tidyverse
функции для объединения оценок коэффициентов и p-значений и редактирования имен столбцов, а также kable
а также kableExtra
пакеты для производства латекса.
rmarkdown
документ
---
title: "Coefficient Table for Durbin Lag Model"
author: "eipi10"
date: "8/30/2017"
output: pdf_document
---
```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = FALSE, message=FALSE, warning=FALSE)
library(spdep)
library(texreg)
example(columbus)
listw <- nb2listw(col.gal.nb)
```
```{r}
# spatial regression - Durbin Model
mobj <- lagsarlm(CRIME ~ INC + HOVAL, columbus, listw, type="mixed")
#summary(mobj)
# Calculate direct and indirect impacts
W <- as(listw, "CsparseMatrix")
trMatc <- trW(W, type="mult")
trMC <- trW(W, type="MC")
imp <- impacts(mobj, tr=trMC, R=100)
sums <- summary(imp, zstats=T)
# Return Effects
# data.frame(sums$res)
# Return p-values
# data.frame(sums$pzmat)
```
```{r extractTableData}
library(knitr)
library(kableExtra)
library(dplyr)
library(tidyr)
library(stringr)
# Extract coefficients and p-values
tab = bind_rows(sums$res) %>% t %>% as.data.frame %>%
setNames(., names(sums$res[[1]])) %>%
mutate(Coef_Type=str_to_title(rownames(.)),
Value_Type="Estimate") %>%
bind_rows(sums$pzmat %>% t %>% as.data.frame %>%
mutate(Coef_Type=rownames(.),
Value_Type="p-value")) %>%
gather(key, value, INC, HOVAL)
```
```{r table1}
# Reshape table into desired output format
tab1 = tab %>%
unite(coef, key, Value_Type) %>%
spread(coef, value) %>%
mutate_if(is.numeric, round, 3)
# Change column names to what we want to see in the output table
names(tab1) = c("", gsub(".*_(.*)", "\\1", names(tab1)[-1]))
# Output latex table, including extra header row to mark coefficient names
kable(tab1, booktabs=TRUE, format="latex") %>%
add_header_above(setNames(c("", 2, 2), c("", sort(rownames(sums$pzmat))))) %>%
kable_styling(position="center")
```
\vspace{1cm}
```{r table2}
# Reshape table into desired output format
tab2 = tab %>%
unite(coef, Coef_Type, Value_Type) %>%
spread(coef, value) %>%
mutate_if(is.numeric, round, 3)
# Change column names to what we want to see in the output table
names(tab2) = c("Coefficient", gsub(".*_(.*)", "\\1", names(tab2)[-1]))
# Output latex table, including extra header row to mark coefficient names
kable(tab2, booktabs=TRUE, format="latex") %>%
add_header_above(setNames(c(" ", rep(2, 3)), c("", colnames(sums$pzmat)))) %>%
kable_styling(position="center")
```