Импорт модуля rpy в python

Question

Импорт модуля rpy в python

Я пытаюсь импортировать модуль rpy1.0.3 для python2.6.6, используя:

from rpy import *

и получаю эту ошибку:

File "C:\Python26\lib\site-packages\rpy.py", line 58, in <module>
    RVERSION = rpy_tools.get_R_VERSION(RHOME)
  File "C:\Python26\lib\site-packages\rpy_tools.py", line 103, in get_R_VERSION
    raise RuntimeError("Couldn't obtain version number from output\n"
RuntimeError: Couldn't obtain version number from output
of `R --version'.

Как указано в документации по rpy, я установил переменную окружения с путем к файлу моего каталога R, но, похоже, он не может распознать версию R (у меня установлена 2.9.0). Какие-нибудь мысли? Спасибо

1

python r

Источник

user738897 04 май '11 в 22:44

1 ответ

Другие вопросы по тегам python r

user561849 03 июн '11 в 18:53 2011-06-03 18:53 · Answer 1 · 2011-06-03 18:53

Сценарий setup.py вызывает скрипт rpy_tools.py для получения доступа к номеру версии. Он ищет в выводе R --version регулярное выражение:

version = re.search(" +([0-9]\.[0-9]\.[0-9])", output)

Тем не менее, R теперь в версии 2.13.0, поэтому он не сможет найти двузначный номер версии. Замените эту строку в rpy_tools.py на:

version = re.search(" +([0-9]+\.[0-9]+\.[0-9]+)", output)

Вам также нужно будет удалить файл rpy_tools.pyc, созданный setup.py