Ошибка при попытке установить pyamg: clang: ошибка: нет такого файла или каталога: "-I/.../boost_1_59_0"

Я пытаюсь установить pyamg в моей виртуальной среде. Однако я получаю следующую ошибку. Я использую Mac OS.

c++: pyamg/amg_core/amg_core_wrap.cxx
clang: error: no such file or directory: '“-I/Users/mas/PycharmProjects/kaggle-ndsb/boost_1_59_0”'
clang: error: no such file or directory: '“-I/Users/mas/PycharmProjects/kaggle-ndsb/boost_1_59_0”'
error: Command "c++ -fno-strict-aliasing -fno-common -dynamic -arch x86_64 -arch i386 -g -Os -pipe -fno-common -fno-strict-aliasing -fwrapv -DENABLE_DTRACE -DMACOSX -DNDEBUG -Wall -Wshorten-64-to-32 -DNDEBUG -g -fwrapv -Os -Wall -Wstrict-prototypes -DENABLE_DTRACE “-I/Users/mas/PycharmProjects/kaggle-ndsb/boost_1_59_0” -arch x86_64 -arch i386 -pipe -D__STDC_FORMAT_MACROS=1 -I/Users/mas/PycharmProjects/Whale/Zahraa5/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/include -I/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/include/python2.7 -c pyamg/amg_core/amg_core_wrap.cxx -o build/temp.macosx-10.10-intel-2.7/pyamg/amg_core/amg_core_wrap.o" failed with exit status 1
Источник

3 ответа

Решение

На самом деле, я думаю, что @oarfish правильно назвал это в комментариях. Проблема кажется смешной “ а также ” символы в тех путях, которые отличаются от обычных " символ двойной кавычки.

Следующее воспроизводит ошибку для меня:

~$ CPPFLAGS=“-I/Users/mas/PycharmProjects/kaggle-ndsb/boost_1_59_0” \
   LIBS=“-L/Users/mas/PycharmProjects/kaggle-ndsb/boost_1_59_0/stage/lib” \
   pip install pyamg

Collecting pyamg
  Downloading pyamg-3.0.1.tar.gz (759kB)
    100% |████████████████████████████████| 761kB 33.2MB/s 
Installing collected packages: pyamg
  Running setup.py install for pyamg
...
    creating build/temp.linux-x86_64-2.7
    creating build/temp.linux-x86_64-2.7/pyamg
    creating build/temp.linux-x86_64-2.7/pyamg/amg_core
    compile options: '-D__STDC_FORMAT_MACROS=1 -I/home/alistair/.venvs/pyamg/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/include -I/usr/include/python2.7 -c'
    c++: pyamg/amg_core/amg_core_wrap.cxx
    g++: error: “-I/Users/mas/PycharmProjects/kaggle-ndsb/boost_1_59_0”: No such file or directory
    g++: error: “-I/Users/mas/PycharmProjects/kaggle-ndsb/boost_1_59_0”: No such file or directory
    error: Command "c++ -pthread -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -fno-strict-aliasing -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security “-I/Users/mas/PycharmProjects/kaggle-ndsb/boost_1_59_0” -fPIC -D__STDC_FO
RMAT_MACROS=1 -I/home/alistair/.venvs/pyamg/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/include -I/usr/include/python2.7 -c pyamg/amg_core/amg_core_wrap.cxx -o build/temp.linux-x86_64-2.7/pyamg/amg_core/amg_core_wrap.o" failed with exit 
status 1

    ----------------------------------------
Command "/home/alistair/.venvs/pyamg/bin/python -c "import setuptools, tokenize;__file__='/tmp/pip-build-Cl5_2g/pyamg/setup.py';exec(compile(getattr(tokenize, 'open', open)(__file__).read().replace('\r\n', '\n'), __file__, 'exec'))" insta
ll --record /tmp/pip-kkjcoa-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile --install-headers /home/alistair/.venvs/pyamg/include/site/python2.7/pyamg" failed with error code 1 in /tmp/pip-build-Cl5_2g/pyamg

Тогда как с " символы установка прошла успешно:

~$ CPPFLAGS="-I/Users/mas/PycharmProjects/kaggle-ndsb/boost_1_59_0" \
   LIBS="-L/Users/mas/PycharmProjects/kaggle-ndsb/boost_1_59_0/stage/lib" \
   pip install pyamg
Collecting pyamg
  Using cached pyamg-3.0.1.tar.gz
Installing collected packages: pyamg
  Running setup.py install for pyamg
Successfully installed pyamg-3.0.1

Сами пути не имеют значения - компиляция завершается успешно, несмотря на то, что эти каталоги на самом деле не существуют на моей машине.

Источник

Используйте Анаконду или Миниконду

conda install pyamg

занимает всего несколько секунд.

Вы можете создать среду с:

conda create --name my_env python=2.7

Изменить на это:

source activate my_env

и установить pyamg:

conda install pyamg

Вы все еще можете использовать pip для установки пакетов conda не могу найти.

Жизнь слишком коротка, чтобы тратить время на компиляцию.;)

Источник

Я уверен, что -I в начале путей это то, что все портит. Бьюсь об заклад, если вы попытались добавить эти экспортные заявления обратно в.bashrc, но вынули -I а также -L префиксы, тогда ваша оригинальная команда начнет работать.

Возможно, у вас их есть по какой-то причине, я никогда не видел этого, но удаление этих префиксов, вероятно, сработало бы.

Источник
Другие вопросы по тегам