Можно ли использовать NMDS для проверки линейности данных, сравнивая результаты ординации Eucladion - BrayCurtis?

Question

Я хочу сделать PCA (в R), но я не знаю, являются ли мои данные линейными. Я провел NMDS для расстояния Евклида и Брея-Кертиса. После удаления 1 переменной со многими нулями графики NMDS примерно равны.

Я предполагаю, что линейные данные, построенные в нелинейном ординационном пространстве (Брей-Кертис), дают результаты, аналогичные линейным данным, построенным в линейном ординационном пространстве (евклидово). Это предположение оправдано?

Спасибо!!

Answer 1

Для решения о линейности / унимодальности данных попробуйте использовать decorana функция от vegan пакет для построения DCA и проверки длины оси, как рекомендовано здесь.