Как построить только большие сообщества / кластеры в R

У меня есть игра в g, Поскольку график огромен, я хочу строить сообщества с более чем 10 участники, но я хочу построить их все в одном сюжете. Моя идея удалить ненужные элементы:

g <- delete_vertices(g, V(g)[igraph::clusters(g)$csize < 10])

но по какой-то причине это строит множество отдельных узлов, что противоположно тому, чего я пытаюсь достичь. Можете ли вы сказать мне, где я не прав?

1 ответ

Решение

Ваша идея великолепна, но проблема в том, что

igraph::clusters(g)$csize < 10

возвращает только логический вектор кластеров, содержащих менее 10 членов. Между тем вам нужно знать, какие вершины принадлежат этим кластерам.

Следовательно, мы можем действовать следующим образом.

set.seed(1)
g1 <- erdos.renyi.game(100, 1 / 70)
cls <- clusters(g1)
cls$csize
#  [1]  1  1 43  2 11  1  1  1  2  1  2  5  1  1  4  4  1  1  1  1  2  1  2  1
# [25]  4  1  1  1  1  1 # Two clusters of interest
g2 <- delete_vertices(g1, V(g1)[cls$membership %in% which(cls$csize <= 10)])
plot(g2)

Другие вопросы по тегам