Изменение метки фасета на математическую формулу в ggplot2

Интересно как поменять facet метка для математической формулы в ggplot2,

d <- ggplot(diamonds, aes(carat, price, fill = ..density..)) +
  xlim(0, 2) + stat_binhex(na.rm = TRUE) + opts(aspect.ratio = 1)
d + facet_wrap(~ color, ncol = 4)

Например, я хочу изменить метку фасета с D в Y[1]где 1 - индекс. Заранее спасибо за помощь.

Я нашел этот ответ, но он не работает для меня. я использую R 2.15.1 а также ggplot2 0.9.1,

Источник

5 ответов

Решение

Возможно, кто-то изменил имя функции edit-Grob в какой-то момент. (Редактировать: он был удален @hadley около 8 месяцев назад.) geditGrob но просто editGrob из pkg:grid вроде работает:

 d <- ggplot(diamonds, aes(carat, price, fill = ..density..)) +
              xlim(0, 2) + stat_binhex(na.rm = TRUE) + opts(aspect.ratio = 1)

 #Note: changes in ggplot2 functions cause this to fail from the very beginning now.
 # Frank Harrell's answer this year suggests `facet_warp` now accepts `labeller`


 d <- d + facet_wrap(~ color, ncol = 4)
 grob <- ggplotGrob(d)
 strip_elem <- grid.ls(getGrob(grob, "strip.text.x", grep=TRUE, global=TRUE))$name
#strip.text.x.text.1535
#strip.text.x.text.1541
#strip.text.x.text.1547
#strip.text.x.text.1553
#strip.text.x.text.1559
#strip.text.x.text.1565
#strip.text.x.text.1571
grob <- editGrob(grob, strip_elem[1], label=expression(Y[1]))
grid.draw(grob)
Источник

Вы можете редактировать гробов в gtable,

ggplot(diamonds, aes(carat, price, fill = ..density..)) +
  xlim(0, 2) + stat_binhex(na.rm = TRUE) + facet_wrap(~ color, ncol = 4)


for(ii in 1:7)
grid.gedit(gPath(paste0("strip_t-", ii), "strip.text"), 
           grep=TRUE, label=bquote(gamma[.(ii)]))

введите описание изображения здесь

в качестве альтернативы, если вы хотите сохранить гроб,

g <- ggplotGrob(d)
gg <- g$grobs

strips <- grep("strip_t", names(gg))
for(ii in strips)
  gg[[ii]] <- editGrob(getGrob(gg[[ii]], "strip.text", 
                               grep=TRUE, global=TRUE), 
                       label=bquote(gamma[.(ii)]))

g$grobs <- gg

использование ggsave потребовало бы дополнительной (безобразной) работы, так как нужно обмануть тест для класса ggplot... Я считаю, что будет проще вызвать pdf() ; grid.draw(g); dev.off() в явном виде.

Редактировать Роландом:

Я сделал небольшое исправление и обернул его в функцию:

facet_wrap_labeller <- function(gg.plot,labels=NULL) {
  #works with R 3.0.1 and ggplot2 0.9.3.1
  require(gridExtra)

  g <- ggplotGrob(gg.plot)
  gg <- g$grobs      
  strips <- grep("strip_t", names(gg))

  for(ii in seq_along(labels))  {
    modgrob <- getGrob(gg[[strips[ii]]], "strip.text", 
                       grep=TRUE, global=TRUE)
    gg[[strips[ii]]]$children[[modgrob$name]] <- editGrob(modgrob,label=labels[ii])
  }

  g$grobs <- gg
  class(g) = c("arrange", "ggplot",class(g)) 
  g
}

Это позволяет печатать красиво и даже ggsave может быть использован.

Источник

По состоянию на ggplot2 2.1.0 labeller был реализован для facet_wrap,

Источник

Только что натолкнулся на эту очень полезную функцию от roland и baptiste, но нуждался в немного другом случае использования, где оригинальные заголовки переноса должны быть преобразованы функцией, а не предоставлены как фиксированное значение. Я публикую немного измененную версию оригинальной функции на случай, если она пригодится кому-либо еще. Это позволяет использовать как именованные (фиксированные значения) выражения для полосок переноса, так и использовать пользовательские функции и функции, уже предоставленные ggplot2 для facet_gridlabeller параметр (такой как label_parsed а также label_bquote).

facet_wrap_labeller <- function(gg.plot, labels = NULL, labeller = label_value) {
  #works with R 3.1.2 and ggplot2 1.0.1
  require(gridExtra)

  # old labels
  g <- ggplotGrob(gg.plot)
  gg <- g$grobs      
  strips <- grep("strip_t", names(gg))
  modgrobs <- lapply(strips, function(i) {
    getGrob(gg[[i]], "strip.text", grep=TRUE, global=TRUE)
  })
  old_labels <- sapply(modgrobs, function(i) i$label)

  # find new labels
  if (is.null(labels)) # no labels given, use labeller function
    new_labels <- labeller(names(gg.plot$facet$facets), old_labels)
  else if (is.null(names(labels))) # unnamed list of labels, take them in order
    new_labels <- as.list(labels)
  else { # named list of labels, go by name where provided, otherwise keep old
    new_labels <- sapply(as.list(old_labels), function(i) {
      if (!is.null(labels[[i]])) labels[[i]] else i
    })
  }

  # replace labels
  for(i in 1:length(strips))  {
    gg[[strips[i]]]$children[[modgrobs[[i]]$name]] <- 
       editGrob(modgrobs[[i]], label=new_labels[[i]])
  }

  g$grobs <- gg
  class(g) = c("arrange", "ggplot",class(g))
  return(g) 
}

Обновление / предупреждение

Для более новых версий gridExtra пакет вы получите ошибку Error: No layers in plot при запуске этой функции, потому что arrange больше не в gridExtra и R пытается интерпретировать это как ggplot, Вы можете исправить это путем (повторного) введения print функция для arrange учебный класс:

print.arrange <- function(x){
    grid::grid.draw(x)
}

Теперь это должно позволить визуализировать график, и вы можете использовать ggsave() например, вот так: ggsave("test.pdf", plot = facet_wrap_labeller(p, labeller = label_parsed))

Примеры

Несколько примеров использования:

# artificial data frame
data <- data.frame(x=runif(16), y=runif(16), panel = rep(c("alpha", "beta", "gamma","delta"), 4))
p <- ggplot(data, aes(x,y)) + geom_point() + facet_wrap(~panel)

# no changes, wrap panel headers stay the same
facet_wrap_labeller(p) 

# replace each panel title statically
facet_wrap_labeller(p, labels = expression(alpha^1, beta^1, gamma^1, delta^1)) 

# only alpha and delta are replaced
facet_wrap_labeller(p, labels = expression(alpha = alpha^2, delta = delta^2)) 

# parse original labels
facet_wrap_labeller(p, labeller = label_parsed) 

# use original labels but modifying them via bquote
facet_wrap_labeller(p, labeller = label_bquote(.(x)^3)) 

# custom function (e.g. for latex to expression conversion)
library(latex2exp)
facet_wrap_labeller(p, labeller = function(var, val) { 
  lapply(paste0("$\\sum\\", val, "$"), latex2exp)
})
Источник

Спасибо за другие ответы и комментарии за упоминание. По-прежнему было не совсем понятно, как использовать синтаксический анализатор меток, поэтому я добавляю сюда простой воспроизводимый пример.

      library(dplyr)
library(ggplot2)
iris %>%
    mutate(Species = factor(Species,
                            levels = c("setosa", "versicolor", "virginica"),
                            labels = c("m^2",
                                       expression(bar(x) == sum(frac(x[i], n), i==1, n)),
                                       expression("Q[t-1]")))) %>%
    ggplot(aes(x = Petal.Length, y = Petal.Width)) +
    geom_point() +
    facet_wrap(~Species, labeller = label_parsed)

Синтаксис отличается от латексной формулы, потому что label_parsedинтерпретирует метку как математическое выражение. Например индексы пишутся x_i в латексе и x[i]в математических выражениях сюжета. Вы можете найти примеры математических формул на странице справки plotmath функция.

Источник
Другие вопросы по тегам