Интерактивное добавление точек к участкам в графике R без перерисовки фонового графика

Это продолжение предыдущего поста ( Интерактивное добавление точек к графику R без перерисовки фонового графика). Я делаю матрицу диаграммы рассеяния (используя ggpairs пакета R) из значений набора данных 32 mtcars. Моя цель - дать пользователям возможность щелкнуть точку в любом из участков. Это приведет к тому, что случайное подмножество (размер может варьироваться, но в приведенном ниже примере равно 2) строк из исходного фрейма данных, которые будут наложены на все вспомогательные участки диаграммы рассеяния (число диаграмм рассеяния может варьироваться, но в приведенном ниже примере это 3).

Мой полу-рабочий MWE выглядит следующим образом -

library(plotly)
library(htmlwidgets)
library(GGally)

dat <- mtcars[,c(3,4,7)]
dat[,3] = dat[,3]*8

p <- ggpairs(dat)

myMax = max(abs(dat))
myMin = min(abs(dat))
myRange = c(myMax, myMin)

p2 <- p
for(x in 2:p$nrow) {
  for(y in 1:(x-1)) {
    p2[x,y] <- p[x,y] +
      coord_cartesian(xlim = c(myRange), ylim = c(myRange))
  }
}

p3 <- ggplotly(p2)

p3 %>% onRender("function(el, x, data) {

    // Number of rows in data frame is myLength=3
    myLength = Math.sqrt(document.getElementsByClassName('cartesianlayer')[0].childNodes.length);

    // AxisNames stores the names of the 3 rows ('disp','hp','qsec')
    AxisNames = [];
    for (i = 1; i < (myLength+1); i++) {
      AxisNames.push(document.getElementsByClassName('infolayer')[0].childNodes[i].textContent);
    }

    el.on('plotly_click', function(e) {
      // Grab two random rows of the 32 rows from mtcars dataset and store in myData. In my real code (not this MWE), myData represents an array of 1 or more objects, where each object contains values for each column in the dataset.
      data1 = data[Math.floor(Math.random() * 32) + 1];
      data2 = data[Math.floor(Math.random() * 32) + 1];
      var myData = [data1, data2];

      //May not be necessary, but this creates one array allData that contains all column values for all randomly selected rows. Since this example has 3 columns (disp, hp, and qsec) and two randomly selected rows, allData has a length of 6.
      var allData = [];
      for (i = 0; i < myData.length; i++){
        for (j = 0 ; j < myLength; j++){
          allData.push(myData[i][AxisNames[j]])
        }
      }
      console.log(allData)

      //This correctly plots the disp on the x-axis and qsec on the y-axis of both randomly selected data frame rows and plots it into the correct scatterplot (bottom left one that has x-axis of disp and y-axis of qsec). This needs to be automated, so that the corresponding x and y values for the 2 randomly selected data frame rows are also plotted on all other scatterplot matrices.
      var trace1 = {
      x: [allData[0], allData[3]],
      y: [allData[2], allData[5]],
      mode: 'markers',
      marker: {
      color: 'green',
      size: 20
      }
      };

      Plotly.addTraces(el.id, trace1);
      }
      )}", data = dat)

В настоящее время происходит случайное выделение строк (отображаются зеленым цветом) только в одном подплощадке слева внизу (а не во всех трех точках рассеяния). У меня трудный доступ и построение графиков на любом другом графике рассеяния, кроме нижнего левого.

ScatMatrix

Возможно, я работаю над методом с гораздо более длинным фреймом данных (порядка тысяч наблюдений за строками) и более широким фреймом данных (более трех столбцов, в результате чего рисуется более трех диаграмм рассеяния). Поэтому я пытаюсь найти эффективный способ достижения этой цели, чтобы очки не заняли слишком много времени. Я полагаю (из чтения), что каждый Plotly.addTraces() может замедлить время прорисовки. Если бы фрейм данных имел, скажем, 6 столбцов, то было бы 15 диаграмм рассеяния, и если бы каждая диаграмма рассеяния имела свои собственные addTraces(), то было бы 15 addTraces(). Интересно, если бы это сделало рисование точек слишком медленным? Если это так, я бы очень хотел услышать совет о том, как достичь этой цели наиболее эффективно (позволяя наносить зеленые точки как можно быстрее на всех точках рассеяния).

Буду очень признателен за любую помощь или идеи!

РЕДАКТИРОВАТЬ:

Благодаря вкладу NicE я смог обновить этот скрипт, чтобы ему не нужно было жестко кодировать метки осей и переменные, которые будут использоваться в каждом подзадаче. Обновленный MWE ниже:

library(plotly)
library(htmlwidgets)
library(GGally)

dat <- mtcars[,c(3,4,7)]
dat[,3] = dat[,3]*8

p <- ggpairs(dat)

myMax = max(abs(dat))
myMin = min(abs(dat))
myRange = c(myMax, myMin)

p2 <- p
for(x in 2:p$nrow) {
  for(y in 1:(x-1)) {
    p2[x,y] <- p[x,y] +
      coord_cartesian(xlim = c(myRange), ylim = c(myRange))
  }
}

p3 <- ggplotly(p2)

p3 %>% onRender("function(el, x, data) {

                len = Math.sqrt(document.getElementsByClassName('cartesianlayer')[0].childNodes.length);

                // AxisNames stores the names of the 3 rows ('disp','hp','qsec')
                AxisNames = [];
                for (i = 1; i < (len+1); i++) {
                AxisNames.push(document.getElementsByClassName('infolayer')[0].childNodes[i].textContent);
                }

                el.on('plotly_click', function(e) {
                  data1 = data[Math.floor(Math.random() * 32) + 1];
                  data2 = data[Math.floor(Math.random() * 32) + 1];
                  var myData = [data1, data2];
                  console.log(myData);

                  var Traces = [];
                  var i=0;
                  var k=1;
                  while ((i*len+k)<=Math.pow((len-1),2)) {
                        var xArr = [];
                        for (a=0; a<myData.length; a++){
                          xArr.push(myData[a][AxisNames[i]])
                        }
                    while ((i+k)<len){
                        var yArr = [];
                        for (a=0; a<myData.length; a++){
                          yArr.push(myData[a][AxisNames[(len-k)]])
                        }

                      var trace = {
                        x: xArr,
                        y: yArr,
                        mode: 'markers',
                        marker: {
                          color: 'green',
                          size: 20
                        },
                        xaxis: 'x' + (i+1),
                        yaxis: 'y' + (i*len+k)
                      };
                      Traces.push(trace);
                      k++;
                    }
                    i++;
                    k=1;
                  }
                  Plotly.addTraces(el.id, Traces);
                }
                )}", data = dat)

1 ответ

Вы можете добавить xaxis а также yaxis к вашим трассам, чтобы указать, к какому графику трасса должна быть добавлена.

В вашем случае xaxis для первого столбца xвторое x2и третий x3, yaxis нижнего левого участка y и это увеличивает идти вверх, y2 для вышеупомянутого, y3 для верхней части первого столбца, затем y4 для нижней колонки среднего столбца и т.д...

Например, вы могли бы сделать в своем onRender:

var trace1 = {
  x: [myData[0]['disp'], myData[1]['disp']],
  y: [myData[0]['qsec'], myData[0]['qsec']],
  mode: 'markers',
  marker: {
    color: 'green',
    size: 20
  },
  xaxis: 'x',
  yaxis: 'y'
};

var trace2 = {
  x: [myData[0]['disp'], myData[1]['disp']],
  y: [myData[0]['hp'], myData[0]['hp']],
  mode: 'markers',
  marker: {
    color: 'green',
    size: 20
  },
  xaxis: 'x',
  yaxis: 'y2'
};

var trace3 = {
  x: [myData[0]['hp'], myData[0]['hp']],
  y: [myData[0]['qsec'], myData[0]['qsec']],
  mode: 'markers',
  marker: {
    color: 'green',
    size: 20
  },
  xaxis: 'x2',
  yaxis: 'y4'
};

Plotly.addTraces(el.id, [trace1,trace2,trace3]);
Другие вопросы по тегам